A simplified cerebellar Purkinje neuron (the PPR model) (Brown et al. 2011)

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Accession:126637
These models were implemented in NEURON by Sherry-Ann Brown in the laboratory of Leslie M. Loew. The files reproduce Figures 2c-f from Brown et al, 2011 "Virtual NEURON: a Strategy For Merged Biochemical and Electrophysiological Modeling".
Reference:
1 . Brown SA, Moraru II, Schaff JC, Loew LM (2011) Virtual NEURON: a strategy for merged biochemical and electrophysiological modeling. J Comput Neurosci 31:385-400 [PubMed]
Citations  Citation Browser
Model Information (Click on a link to find other models with that property)
Model Type: Neuron or other electrically excitable cell; Dendrite;
Brain Region(s)/Organism: Cerebellum;
Cell Type(s): Cerebellum Purkinje GABA cell;
Channel(s): I Na,p; I p,q; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium;
Gap Junctions:
Receptor(s):
Gene(s):
Transmitter(s):
Simulation Environment: NEURON;
Model Concept(s): Dendritic Action Potentials; Simplified Models; Active Dendrites; Influence of Dendritic Geometry; Detailed Neuronal Models; Intrinsic plasticity; Methods; Synaptic Integration;
Implementer(s): Brown, Sherry-Ann [sabrown at student.uchc.edu];
Search NeuronDB for information about:  Cerebellum Purkinje GABA cell; I Na,p; I p,q; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium;
/*
Purkinje_spine and spine neck at spinydendrite133.hoc

A hoc file for a cerebellar Purkinje neuron.

Adapted by SHERRY-ANN BROWN in "Virtual NEURON: a Strategy For Merged Biochemical and Electrophysiological Modeling"(Brown et al., 2010)
from original code written by MIYASHO Tsugumichi and MIYAKAWA Hiroyoshi.

This model runs on NEURON (version 3.2.3).

Description of the original version of this model can be found in 
"Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate
Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons : a modeling study"(T. Miyasho et al., Brain Res 891, 2001, 106-115)

Morphology of the original cell used for the original model was taken from a paper by D.P.Shelton (Neuroscience 14, 1985, 111-131).

Channel descriptions are taken from a paper by E.De.Shutter and 
J.M.Bower. (J. Neurophysiol., 71, 1994, 375-400)

*/
xopen("$(NEURONHOME)/lib/hoc/noload.hoc")

{load_proc("nrnmainmenu")} 
/*
{
	load_template("Inserter")
	load_template("Electrode")
	load_template("PointProcessManager")
	load_template("PointProcessLocator")
	load_template("ShowMechanism")
}
*/
NumSmoothDendrite=85
NumSpinyDendrite=1002
NumSpineNeck=1
NumSpine=1

create soma, SmoothDendrite[NumSmoothDendrite], SpinyDendrite[NumSpinyDendrite], SpineNeck[NumSpineNeck], Spine[NumSpine]
access soma
    soma connect SmoothDendrite[0](0),1
    soma	      {nseg=1 L=22 diam=22 }
    SmoothDendrite[0] {nseg=1 L=18 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[1](0),1
    SmoothDendrite[1] {nseg=1 L=39 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[2](0),1
    SmoothDendrite[2] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[3](0),1
    SmoothDendrite[3] {nseg=1 L=7 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[4](0),1
    SmoothDendrite[4] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[4] connect SmoothDendrite[5](0),1
    SmoothDendrite[5] {nseg=1 L=10 diam=2 }

    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[6](0),1
    SmoothDendrite[6] {nseg=1 L=10 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[7](0),1
    SmoothDendrite[7] {nseg=1 L=37 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[8](0),1
    SmoothDendrite[8] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[9](0),1
    SmoothDendrite[9] {nseg=1 L=15 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[10](0),1
    SmoothDendrite[10] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[11](0),1
    SmoothDendrite[11] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[11] connect SmoothDendrite[12](0),1
    SmoothDendrite[12] {nseg=1 L=7 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[12] connect SmoothDendrite[13](0),1
    SmoothDendrite[13] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[13] connect SmoothDendrite[14](0),1
    SmoothDendrite[14] {nseg=1 L=32 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[15](0),1
    SmoothDendrite[15] {nseg=1 L=11 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[17] connect SmoothDendrite[16](0),1
    SmoothDendrite[16] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[17](0),1
    SmoothDendrite[17] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[15] connect SmoothDendrite[18](0),1
    SmoothDendrite[18] {nseg=1 L=12 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[18] connect SmoothDendrite[19](0),1
    SmoothDendrite[19] {nseg=1 L=8 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[19] connect SmoothDendrite[20](0),1
    SmoothDendrite[20] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[20] connect SmoothDendrite[21](0),1
    SmoothDendrite[21] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[21] connect SmoothDendrite[22](0),1
    SmoothDendrite[22] {nseg=1 L=27 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[22] connect SmoothDendrite[23](0),1
    SmoothDendrite[23] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[23] connect SmoothDendrite[24](0),1
    SmoothDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[25](0),1
    SmoothDendrite[25] {nseg=1 L=10 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[26](0),1
    SmoothDendrite[26] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[26] connect SmoothDendrite[27](0),1
    SmoothDendrite[27] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[27] connect SmoothDendrite[28](0),1
    SmoothDendrite[28] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[28] connect SmoothDendrite[29](0),1
    SmoothDendrite[29] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[30](0),1
    SmoothDendrite[30] {nseg=1 L=12 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[30] connect SmoothDendrite[31](0),1
    SmoothDendrite[31] {nseg=1 L=6 diam=5 }

    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[32](0),1
    SmoothDendrite[32] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[32] connect SmoothDendrite[33](0),1
    SmoothDendrite[33] {nseg=1 L=13 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[33] connect SmoothDendrite[34](0),1
    SmoothDendrite[34] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[35](0),1
    SmoothDendrite[35] {nseg=1 L=22 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[36](0),1
    SmoothDendrite[36] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[37](0),1
    SmoothDendrite[37] {nseg=1 L=4 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[37] connect SmoothDendrite[38](0),1
    SmoothDendrite[38] {nseg=1 L=20 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[39](0),1
    SmoothDendrite[39] {nseg=1 L=23 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[40](0),1
    SmoothDendrite[40] {nseg=1 L=6 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[40] connect SmoothDendrite[41](0),1
    SmoothDendrite[41] {nseg=1 L=4 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[42](0),1
    SmoothDendrite[42] {nseg=1 L=1 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[42] connect SmoothDendrite[43](0),1
    SmoothDendrite[43] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[44](0),1
    SmoothDendrite[44] {nseg=1 L=18 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[45](0),1
    SmoothDendrite[45] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[45] connect SmoothDendrite[46](0),1
    SmoothDendrite[46] {nseg=1 L=20 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[47](0),1
    SmoothDendrite[47] {nseg=1 L=8 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[47] connect SmoothDendrite[48](0),1
    SmoothDendrite[48] {nseg=1 L=5 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[48] connect SmoothDendrite[49](0),1
    SmoothDendrite[49] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[49] connect SmoothDendrite[50](0),1
    SmoothDendrite[50] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[50] connect SmoothDendrite[51](0),1
    SmoothDendrite[51] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[52](0),1
    SmoothDendrite[52] {nseg=1 L=22 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[53](0),1
    SmoothDendrite[53] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[53] connect SmoothDendrite[54](0),1
    SmoothDendrite[54] {nseg=1 L=18 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[55](0),1
    SmoothDendrite[55] {nseg=1 L=22 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[56](0),1
    SmoothDendrite[56] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[57](0),1
    SmoothDendrite[57] {nseg=1 L=2 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[57] connect SmoothDendrite[58](0),1
    SmoothDendrite[58] {nseg=1 L=3 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[58] connect SmoothDendrite[59](0),1
    SmoothDendrite[59] {nseg=1 L=3 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[60](0),1
    SmoothDendrite[60] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[61](0),1
    SmoothDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[62](0),1
    SmoothDendrite[62] {nseg=1 L=44 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[63](0),1
    SmoothDendrite[63] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[63] connect SmoothDendrite[64](0),1
    SmoothDendrite[64] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[65](0),1
    SmoothDendrite[65] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[65] connect SmoothDendrite[66](0),1
    SmoothDendrite[66] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[66] connect SmoothDendrite[67](0),1
    SmoothDendrite[67] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[67] connect SmoothDendrite[68](0),1
    SmoothDendrite[68] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[69](0),1
    SmoothDendrite[69] {nseg=1 L=10 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[70](0),1
    SmoothDendrite[70] {nseg=1 L=4 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[70] connect SmoothDendrite[71](0),1
    SmoothDendrite[71] {nseg=1 L=4 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[72](0),1
    SmoothDendrite[72] {nseg=1 L=2 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[72] connect SmoothDendrite[73](0),1
    SmoothDendrite[73] {nseg=1 L=24 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[74](0),1
    SmoothDendrite[74] {nseg=1 L=52 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[74] connect SmoothDendrite[75](0),1
    SmoothDendrite[75] {nseg=1 L=16 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[76](0),1
    SmoothDendrite[76] {nseg=1 L=14 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[76] connect SmoothDendrite[77](0),1
    SmoothDendrite[77] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[77] connect SmoothDendrite[78](0),1
    SmoothDendrite[78] {nseg=1 L=14 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[78] connect SmoothDendrite[79](0),1
    SmoothDendrite[79] {nseg=1 L=24 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[80](0),1
    SmoothDendrite[80] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[81](0),1
    SmoothDendrite[81] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[81] connect SmoothDendrite[82](0),1
    SmoothDendrite[82] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[82] connect SmoothDendrite[83](0),1
    SmoothDendrite[83] {nseg=1 L=6 diam=2 }

    SmoothDendrite[83] connect SmoothDendrite[84](0),1
    SmoothDendrite[84] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    soma               {cm=0.8    
         insert Leak gl_Leak = 0.00006 el_Leak = -80
	 insert NaF  gnabar_NaF = 10
         insert NaP
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.0005
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0
         insert Khh
         insert KM
         insert KA 
         insert KD  gkbar_KD  = 0
         insert Kh   gkbar_Kh = 0.0005
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}
    for i=0,84 SmoothDendrite[i]  {cm=0.8  
         insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0.0015
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0.008
         insert Khh gkbar_Khh = 0.0006
         insert KM  gkbar_KM  = 0.00001
         insert KA  gkbar_KA  = 0.08
         insert KD  gkbar_KD  = 0.09
         insert KC3 gkbar_KC3  = 0.06
         insert K23
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}


/**** Spiny 1 ****/
    SmoothDendrite[53] connect SpinyDendrite[0](0),1
    SpinyDendrite[0] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 

/**** Spiny 2 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[1](0),1
    SpinyDendrite[1] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[2](0),1
    SpinyDendrite[2] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[3](0),1
    SpinyDendrite[3] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[4](0),1
    SpinyDendrite[4] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[5](0),1
    SpinyDendrite[5] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[6](0),1
    SpinyDendrite[6] {nseg=1 L=5 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[7](0),1
    SpinyDendrite[7] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
 
/**** Spiny 3 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[8](0),1
    SpinyDendrite[8] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[9](0),1
    SpinyDendrite[9] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[10](0),1
    SpinyDendrite[10] {nseg=1 L=5 diam=2.0 }
 
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[11](0),1
    SpinyDendrite[11] {nseg=1 L=10 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[12](0),1
    SpinyDendrite[12] {nseg=1 L=2 diam=2.0 }
 
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[13](0),1
    SpinyDendrite[13] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[14](0),1
    SpinyDendrite[14] {nseg=1 L=7 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[15](0),1
    SpinyDendrite[15] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[16](0),1
    SpinyDendrite[16] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[17](0),1
    SpinyDendrite[17] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[18](0),1
    SpinyDendrite[18] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[19](0),1
    SpinyDendrite[19] {nseg=1 L=3 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[20](0),1
    SpinyDendrite[20] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[21](0),1
    SpinyDendrite[21] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[22](0),1
    SpinyDendrite[22] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[23](0),1
    SpinyDendrite[23] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[24](0),1
    SpinyDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[25](0),1
    SpinyDendrite[25] {nseg=1 L=2 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[26](0),1
    SpinyDendrite[26] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[27](0),1
    SpinyDendrite[27] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[28](0),1
    SpinyDendrite[28] {nseg=1 L=4 diam=1 }


/**** Spiny 4 ****/
    SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[29](0),1
    SpinyDendrite[29] {nseg=1 L=11 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[30](0),1
    SpinyDendrite[30] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[31](0),1
    SpinyDendrite[31] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[32](0),1
    SpinyDendrite[32] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[33](0),1
    SpinyDendrite[33] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[34](0),1
    SpinyDendrite[34] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[35](0),1
    SpinyDendrite[35] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[36](0),1
    SpinyDendrite[36] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[37](0),1
    SpinyDendrite[37] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[38](0),1
    SpinyDendrite[38] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[39](0),1
    SpinyDendrite[39] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[40](0),1
    SpinyDendrite[40] {nseg=1 L=7 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[41](0),1
    SpinyDendrite[41] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[42](0),1
    SpinyDendrite[42] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[43](0),1
    SpinyDendrite[43] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[44](0),1
    SpinyDendrite[44] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[45](0),1
    SpinyDendrite[45] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[46](0),1
    SpinyDendrite[46] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[47](0),1
    SpinyDendrite[47] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[46] connect SpinyDendrite[48](0),1
    SpinyDendrite[48] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[47] connect SpinyDendrite[49](0),1
    SpinyDendrite[49] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 5 ****/
    SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[50](0),1
    SpinyDendrite[50] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[50] connect SpinyDendrite[51](0),1
    SpinyDendrite[51] {nseg=1 L=17 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[50] connect SpinyDendrite[52](0),1
    SpinyDendrite[52] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[52] connect SpinyDendrite[53](0),1
    SpinyDendrite[53] {nseg=1 L=16 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[53] connect SpinyDendrite[54](0),1
    SpinyDendrite[54] {nseg=1 L=15 diam=1}
 
    SpinyDendrite[53] connect SpinyDendrite[55](0),1
    SpinyDendrite[55] {nseg=1 L=3 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[52] connect SpinyDendrite[56](0),1
    SpinyDendrite[56] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[56] connect SpinyDendrite[57](0),1
    SpinyDendrite[57] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[56] connect SpinyDendrite[58](0),1
    SpinyDendrite[58] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[58] connect SpinyDendrite[59](0),1
    SpinyDendrite[59] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[58] connect SpinyDendrite[60](0),1
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    SpinyDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[62] {nseg=1 L=7 diam=1 }


/**** Spiny 6 ****/
    SmoothDendrite[57] connect SpinyDendrite[63](0),1
    SpinyDendrite[63] {nseg=1 L=16 diam=1.4 }
 
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    SpinyDendrite[64] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[63] connect SpinyDendrite[65](0),1
    SpinyDendrite[65] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
/**** Spiny 7 ****/
    SmoothDendrite[58] connect SpinyDendrite[66](0),1
    SpinyDendrite[66] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
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    SpinyDendrite[67] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[66] connect SpinyDendrite[68](0),1
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/**** Spiny 8 ****/
    SmoothDendrite[70] connect SpinyDendrite[69](0),1
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    SpinyDendrite[69] connect SpinyDendrite[71](0),1
    SpinyDendrite[71] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[71] connect SpinyDendrite[72](0),1
    SpinyDendrite[72] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[71] connect SpinyDendrite[73](0),1
    SpinyDendrite[73] {nseg=1 L=9 diam=1 }
 

/**** Spiny 9 ****/
    SmoothDendrite[71] connect SpinyDendrite[74](0),1
    SpinyDendrite[74] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[74] connect SpinyDendrite[75](0),1
    SpinyDendrite[75] {nseg=1 L=22 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[75] connect SpinyDendrite[76](0),1
    SpinyDendrite[76] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[76] connect SpinyDendrite[77](0),1
    SpinyDendrite[77] {nseg=1 L=14 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[76] connect SpinyDendrite[78](0),1
    SpinyDendrite[78] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[79] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[74] connect SpinyDendrite[80](0),1
    SpinyDendrite[80] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[80] connect SpinyDendrite[81](0),1
    SpinyDendrite[81] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[80] connect SpinyDendrite[82](0),1
    SpinyDendrite[82] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[82] connect SpinyDendrite[83](0),1
    SpinyDendrite[83] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[82] connect SpinyDendrite[84](0),1
    SpinyDendrite[84] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[84] connect SpinyDendrite[85](0),1
    SpinyDendrite[85] {nseg=1 L=23 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[84] connect SpinyDendrite[86](0),1
    SpinyDendrite[86] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[86] connect SpinyDendrite[87](0),1
    SpinyDendrite[87] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[86] connect SpinyDendrite[88](0),1
    SpinyDendrite[88] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 10 ****/
    SmoothDendrite[71] connect SpinyDendrite[89](0),1
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    SpinyDendrite[89] connect SpinyDendrite[90](0),1
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    SpinyDendrite[91] {nseg=1 L=26 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[90] connect SpinyDendrite[92](0),1
    SpinyDendrite[92] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[89] connect SpinyDendrite[93](0),1
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    SpinyDendrite[93] connect SpinyDendrite[94](0),1
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    SpinyDendrite[93] connect SpinyDendrite[95](0),1
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    SpinyDendrite[95] connect SpinyDendrite[96](0),1
    SpinyDendrite[96] {nseg=1 L=11 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[95] connect SpinyDendrite[97](0),1
    SpinyDendrite[97] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[97] connect SpinyDendrite[98](0),1
    SpinyDendrite[98] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[97] connect SpinyDendrite[99](0),1
    SpinyDendrite[99] {nseg=1 L=7 diam=1 }


/**** Spiny 11 ****/
    SmoothDendrite[72] connect SpinyDendrite[100](0),1
    SpinyDendrite[100] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[100] connect SpinyDendrite[101](0),1
    SpinyDendrite[101] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[100] connect SpinyDendrite[102](0),1
    SpinyDendrite[102] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[102] connect SpinyDendrite[103](0),1
    SpinyDendrite[103] {nseg=1 L=16 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[102] connect SpinyDendrite[104](0),1
    SpinyDendrite[104] {nseg=1 L=13 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[104] connect SpinyDendrite[105](0),1
    SpinyDendrite[105] {nseg=1 L=9 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[105] connect SpinyDendrite[106](0),1
    SpinyDendrite[106] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[105] connect SpinyDendrite[107](0),1
    SpinyDendrite[107] {nseg=1 L=3 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[104] connect SpinyDendrite[108](0),1
    SpinyDendrite[108] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[108] connect SpinyDendrite[109](0),1
    SpinyDendrite[109] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[108] connect SpinyDendrite[110](0),1
    SpinyDendrite[110] {nseg=1 L=23 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[110] connect SpinyDendrite[111](0),1
    SpinyDendrite[111] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[110] connect SpinyDendrite[112](0),1
    SpinyDendrite[112] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 12 ****/
    SmoothDendrite[77] connect SpinyDendrite[113](0),1
    SpinyDendrite[113] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[113] connect SpinyDendrite[114](0),1
    SpinyDendrite[114] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[114] connect SpinyDendrite[115](0),1
    SpinyDendrite[115] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[115] connect SpinyDendrite[116](0),1
    SpinyDendrite[116] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[116] connect SpinyDendrite[117](0),1
    SpinyDendrite[117] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[116] connect SpinyDendrite[118](0),1
    SpinyDendrite[118] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[114] connect SpinyDendrite[119](0),1
    SpinyDendrite[119] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[115] connect SpinyDendrite[120](0),1
    SpinyDendrite[120] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[113] connect SpinyDendrite[121](0),1
    SpinyDendrite[121] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[121] connect SpinyDendrite[122](0),1
    SpinyDendrite[122] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[122] connect SpinyDendrite[123](0),1
    SpinyDendrite[123] {nseg=1 L=16 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[122] connect SpinyDendrite[124](0),1
    SpinyDendrite[124] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[121] connect SpinyDendrite[125](0),1
    SpinyDendrite[125] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[125] connect SpinyDendrite[126](0),1
    SpinyDendrite[126] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[126] connect SpinyDendrite[127](0),1
    SpinyDendrite[127] {nseg=1 L=9 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[126] connect SpinyDendrite[128](0),1
    SpinyDendrite[128] {nseg=1 L=9 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[125] connect SpinyDendrite[129](0),1
    SpinyDendrite[129] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[129] connect SpinyDendrite[130](0),1
    SpinyDendrite[130] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[129] connect SpinyDendrite[131](0),1
    SpinyDendrite[131] {nseg=1 L=9 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[131] connect SpinyDendrite[132](0),1
    SpinyDendrite[132] {nseg=1 L=15 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[131] connect SpinyDendrite[133](0),1
    SpinyDendrite[133] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[133] connect SpineNeck (0),1
    SpineNeck {nseg=1 L=0.66 diam=0.2 }

    SpineNeck connect Spine (0),1
    Spine {nseg=1 L=0.57 diam=0.57 }


/**** Spiny 13 ****/
    SmoothDendrite[78] connect SpinyDendrite[134](0),1
    SpinyDendrite[134] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[134] connect SpinyDendrite[135](0),1
    SpinyDendrite[135] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[135] connect SpinyDendrite[136](0),1
    SpinyDendrite[136] {nseg=1 L=14 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[135] connect SpinyDendrite[137](0),1
    SpinyDendrite[137] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[134] connect SpinyDendrite[138](0),1
    SpinyDendrite[138] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[138] connect SpinyDendrite[139](0),1
    SpinyDendrite[139] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[140](0),1
    SpinyDendrite[140] {nseg=1 L=24 diam=1 }

    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[141](0),1
    SpinyDendrite[141] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[138] connect SpinyDendrite[142](0),1
    SpinyDendrite[142] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[143](0),1
    SpinyDendrite[143] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[144](0),1
    SpinyDendrite[144] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[144] connect SpinyDendrite[145](0),1
    SpinyDendrite[145] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[144] connect SpinyDendrite[146](0),1
    SpinyDendrite[146] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[147](0),1
    SpinyDendrite[147] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[148](0),1
    SpinyDendrite[148] {nseg=1 L=6 diam=1 }
/**** Spiny 14 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[149](0),1
    SpinyDendrite[149] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[150](0),1
    SpinyDendrite[150] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[150] connect SpinyDendrite[151](0),1
    SpinyDendrite[151] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[150] connect SpinyDendrite[152](0),1
    SpinyDendrite[152] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[153](0),1
    SpinyDendrite[153] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[154](0),1
    SpinyDendrite[154] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[155](0),1
    SpinyDendrite[155] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[155] connect SpinyDendrite[156](0),1
    SpinyDendrite[156] {nseg=1 L=9 diam=1}
 
    SpinyDendrite[155] connect SpinyDendrite[157](0),1
    SpinyDendrite[157] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[157] connect SpinyDendrite[158](0),1
    SpinyDendrite[158] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[157] connect SpinyDendrite[159](0),1
    SpinyDendrite[159] {nseg=1 L=24 diam=1 }


/**** Spiny 15 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[160](0),1
    SpinyDendrite[160] {nseg=1 L=14 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[160] connect SpinyDendrite[161](0),1
    SpinyDendrite[161] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[160] connect SpinyDendrite[162](0),1
    SpinyDendrite[162] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[163](0),1
    SpinyDendrite[163] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[164](0),1
    SpinyDendrite[164] {nseg=1 L=10 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[164] connect SpinyDendrite[165](0),1
    SpinyDendrite[165] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[166](0),1
    SpinyDendrite[166] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[167](0),1
    SpinyDendrite[167] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[164] connect SpinyDendrite[168](0),1
    SpinyDendrite[168] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[169](0),1
    SpinyDendrite[169] {nseg=1 L=26 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[170](0),1
    SpinyDendrite[170] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[171](0),1
    SpinyDendrite[171] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[172](0),1
    SpinyDendrite[172] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 16 ****/
    SmoothDendrite[81] connect SpinyDendrite[173](0),1
    SpinyDendrite[173] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[173] connect SpinyDendrite[174](0),1
    SpinyDendrite[174] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[173] connect SpinyDendrite[175](0),1
    SpinyDendrite[175] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 17 ****/
    SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[176](0),1
    SpinyDendrite[176] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[177](0),1
    SpinyDendrite[177] {nseg=1 L=40 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[178](0),1
    SpinyDendrite[178] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[179](0),1
    SpinyDendrite[179] {nseg=1 L=11 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[180](0),1
    SpinyDendrite[180] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[181](0),1
    SpinyDendrite[181] {nseg=1 L=17 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[182](0),1
    SpinyDendrite[182] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[183](0),1
    SpinyDendrite[183] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[184](0),1
    SpinyDendrite[184] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[185](0),1
    SpinyDendrite[185] {nseg=1 L=22 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[186](0),1
    SpinyDendrite[186] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[186] connect SpinyDendrite[187](0),1
    SpinyDendrite[187] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[186] connect SpinyDendrite[188](0),1
    SpinyDendrite[188] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 18 ****/
    SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[189](0),1
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/**** Spiny 19 ****/
    SmoothDendrite[83] connect SpinyDendrite[200](0),1
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/**** Spiny 20 ****/
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/**** Spiny 21 ****/
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/**** Spiny 22 ****/
    SmoothDendrite[75] connect SpinyDendrite[217](0),1
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    SpinyDendrite[235] connect SpinyDendrite[236](0),1
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/**** Spiny 23 ****/
    SmoothDendrite[75] connect SpinyDendrite[238](0),1
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    SpinyDendrite[239] connect SpinyDendrite[245](0),1
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    SpinyDendrite[240] connect SpinyDendrite[246](0),1
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    SpinyDendrite[248] connect SpinyDendrite[249](0),1
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    SpinyDendrite[253] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[252] connect SpinyDendrite[254](0),1
    SpinyDendrite[254] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[254] connect SpinyDendrite[255](0),1
    SpinyDendrite[255] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[254] connect SpinyDendrite[256](0),1
    SpinyDendrite[256] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[256] connect SpinyDendrite[257](0),1
    SpinyDendrite[257] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[256] connect SpinyDendrite[258](0),1
    SpinyDendrite[258] {nseg=1 L=11 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[258] connect SpinyDendrite[259](0),1
    SpinyDendrite[259] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[258] connect SpinyDendrite[260](0),1
    SpinyDendrite[260] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
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    SpinyDendrite[261] {nseg=1 L=17 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[262] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[262] connect SpinyDendrite[263](0),1
    SpinyDendrite[263] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[262] connect SpinyDendrite[264](0),1
    SpinyDendrite[264] {nseg=1 L=10 diam=1 }


/**** Spiny 24 ****/
    SmoothDendrite[74] connect SpinyDendrite[265](0),1
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    SpinyDendrite[265] connect SpinyDendrite[266](0),1
    SpinyDendrite[266] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[265] connect SpinyDendrite[267](0),1
    SpinyDendrite[267] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 25 ****/
    SmoothDendrite[64] connect SpinyDendrite[268](0),1
    SpinyDendrite[268] {nseg=1 L=14 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[268] connect SpinyDendrite[269](0),1
    SpinyDendrite[269] {nseg=1 L=16 diam=1 }

    SpinyDendrite[268] connect SpinyDendrite[270](0),1
    SpinyDendrite[270] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    SpinyDendrite[270] connect SpinyDendrite[271](0),1
    SpinyDendrite[271] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[270] connect SpinyDendrite[272](0),1
    SpinyDendrite[272] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[272] connect SpinyDendrite[273](0),1
    SpinyDendrite[273] {nseg=1 L=11 diam=1 }

    SpinyDendrite[272] connect SpinyDendrite[274](0),1
    SpinyDendrite[274] {nseg=1 L=3 diam=2 }

    SpinyDendrite[274] connect SpinyDendrite[275](0),1
    SpinyDendrite[275] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[274] connect SpinyDendrite[276](0),1
    SpinyDendrite[276] {nseg=1 L=7 diam=2 }

    SpinyDendrite[276] connect SpinyDendrite[277](0),1
    SpinyDendrite[277] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[277] connect SpinyDendrite[278](0),1
    SpinyDendrite[278] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[277] connect SpinyDendrite[279](0),1
    SpinyDendrite[279] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[276] connect SpinyDendrite[280](0),1
    SpinyDendrite[280] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[280] connect SpinyDendrite[281](0),1
    SpinyDendrite[281] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[280] connect SpinyDendrite[282](0),1
    SpinyDendrite[282] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[282] connect SpinyDendrite[283](0),1
    SpinyDendrite[283] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[282] connect SpinyDendrite[284](0),1
    SpinyDendrite[284] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 26 ****/
    SmoothDendrite[64] connect SpinyDendrite[285](0),1
    SpinyDendrite[285] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[285] connect SpinyDendrite[286](0),1
    SpinyDendrite[286] {nseg=1 L=22 diam=1 }

    SpinyDendrite[285] connect SpinyDendrite[287](0),1
    SpinyDendrite[287] {nseg=1 L=6 diam=2 }

    SpinyDendrite[287] connect SpinyDendrite[288](0),1
    SpinyDendrite[288] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[288] connect SpinyDendrite[289](0),1
    SpinyDendrite[289] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[289] connect SpinyDendrite[290](0),1
    SpinyDendrite[290] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[289] connect SpinyDendrite[291](0),1
    SpinyDendrite[291] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[288] connect SpinyDendrite[292](0),1
    SpinyDendrite[292] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[287] connect SpinyDendrite[293](0),1
    SpinyDendrite[293] {nseg=1 L=15 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[293] connect SpinyDendrite[294](0),1
    SpinyDendrite[294] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[293] connect SpinyDendrite[295](0),1
    SpinyDendrite[295] {nseg=1 L=16 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[295] connect SpinyDendrite[296](0),1
    SpinyDendrite[296] {nseg=1 L=15 diam=1 }

    SpinyDendrite[295] connect SpinyDendrite[297](0),1
    SpinyDendrite[297] {nseg=1 L=8 diam=1 }


/**** Spiny 27 ****/
    SmoothDendrite[63] connect SpinyDendrite[298](0),1
    SpinyDendrite[298] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 

/**** Spiny 28 ****/
    SmoothDendrite[66] connect SpinyDendrite[299](0),1
    SpinyDendrite[299] {nseg=1 L=32 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[299] connect SpinyDendrite[300](0),1
    SpinyDendrite[300] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[299] connect SpinyDendrite[301](0),1
    SpinyDendrite[301] {nseg=1 L=4 diam=1 }


/**** Spiny 29 ****/
    SmoothDendrite[67] connect SpinyDendrite[302](0),1
    SpinyDendrite[302] {nseg=1 L=14 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[302] connect SpinyDendrite[303](0),1
    SpinyDendrite[303] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[302] connect SpinyDendrite[304](0),1
    SpinyDendrite[304] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 30 ****/
    SmoothDendrite[68] connect SpinyDendrite[305](0),1
    SpinyDendrite[305] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[305] connect SpinyDendrite[306](0),1
    SpinyDendrite[306] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[305] connect SpinyDendrite[307](0),1
    SpinyDendrite[307] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    SpinyDendrite[307] connect SpinyDendrite[308](0),1
    SpinyDendrite[308] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[308] connect SpinyDendrite[309](0),1
    SpinyDendrite[309] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[308] connect SpinyDendrite[310](0),1
    SpinyDendrite[310] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[309] connect SpinyDendrite[311](0),1
    SpinyDendrite[311] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[311] connect SpinyDendrite[312](0),1
    SpinyDendrite[312] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[311] connect SpinyDendrite[313](0),1
    SpinyDendrite[313] {nseg=1 L=9 diam=1 }


/**** Spiny 31 ****/
    SmoothDendrite[68] connect SpinyDendrite[314](0),1
    SpinyDendrite[314] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[314] connect SpinyDendrite[315](0),1
    SpinyDendrite[315] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[315] connect SpinyDendrite[316](0),1
    SpinyDendrite[316] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[316] connect SpinyDendrite[317](0),1
    SpinyDendrite[317] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[316] connect SpinyDendrite[318](0),1
    SpinyDendrite[318] {nseg=1 L=11 diam=1 }

    SpinyDendrite[315] connect SpinyDendrite[319](0),1
    SpinyDendrite[319] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[314] connect SpinyDendrite[320](0),1
    SpinyDendrite[320] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[320] connect SpinyDendrite[321](0),1
    SpinyDendrite[321] {nseg=1 L=11 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[321] connect SpinyDendrite[322](0),1
    SpinyDendrite[322] {nseg=1 L=12diam=1 }

    SpinyDendrite[321] connect SpinyDendrite[323](0),1
    SpinyDendrite[323] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[320] connect SpinyDendrite[324](0),1
    SpinyDendrite[324] {nseg=1 L=14 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[324] connect SpinyDendrite[325](0),1
    SpinyDendrite[325] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[324] connect SpinyDendrite[326](0),1
    SpinyDendrite[326] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 32 ****/
    SmoothDendrite[65] connect SpinyDendrite[327](0),1
    SpinyDendrite[327] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[327] connect SpinyDendrite[328](0),1
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    SpinyDendrite[328] connect SpinyDendrite[329](0),1
    SpinyDendrite[329] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[329] connect SpinyDendrite[330](0),1
    SpinyDendrite[330] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[330] connect SpinyDendrite[331](0),1
    SpinyDendrite[331] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[331] connect SpinyDendrite[332](0),1
    SpinyDendrite[332] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[332] connect SpinyDendrite[333](0),1
    SpinyDendrite[333] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[332] connect SpinyDendrite[334](0),1
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    SpinyDendrite[328] connect SpinyDendrite[335](0),1
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/**** Spiny 34 ****/
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/**** Spiny 38 ****/
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/**** Spiny 39 ****/
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/**** Spiny 40 ****/
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/**** Spiny 42 ****/
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/**** Spiny 43 ****/
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/**** Spiny 44 ****/
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    SpinyDendrite[477] connect SpinyDendrite[478](0),1
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    SpinyDendrite[477] connect SpinyDendrite[479](0),1
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    SpinyDendrite[479] connect SpinyDendrite[481](0),1
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/**** Spiny 45 ****/
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/**** Spiny 49 ****/
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/**** Spiny 50 ****/
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    SpinyDendrite[543] connect SpinyDendrite[544](0),1
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/**** Spiny 51 ****/
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/**** Spiny 52 ****/
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/**** Spiny 53 ****/
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/**** Spiny 54 ****/
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/**** Spiny 55 ****/
    SmoothDendrite[46] connect SpinyDendrite[580](0),1
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/**** Spiny 56 ****/
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    SpinyDendrite[614] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[609] connect SpinyDendrite[615](0),1
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    SpinyDendrite[615] connect SpinyDendrite[616](0),1
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    SpinyDendrite[616] connect SpinyDendrite[618](0),1
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    SpinyDendrite[615] connect SpinyDendrite[619](0),1
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    SpinyDendrite[619] connect SpinyDendrite[620](0),1
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    SpinyDendrite[619] connect SpinyDendrite[621](0),1
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/**** Spiny 57 ****/
    SmoothDendrite[40] connect SpinyDendrite[622](0),1
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    SpinyDendrite[622] connect SpinyDendrite[623](0),1
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    SpinyDendrite[627] connect SpinyDendrite[628](0),1
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    SpinyDendrite[628] connect SpinyDendrite[629](0),1
    SpinyDendrite[629] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[628] connect SpinyDendrite[630](0),1
    SpinyDendrite[630] {nseg=1 L=25 diam=1 }

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/**** Spiny 62 ****/
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/**** Spiny 65 ****/
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    SpinyDendrite[732] connect SpinyDendrite[733](0),1
    SpinyDendrite[733] {nseg=1 L=9 diam=1 }

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    SpinyDendrite[731] connect SpinyDendrite[735](0),1
    SpinyDendrite[735] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[730] connect SpinyDendrite[736](0),1
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/**** Spiny 66 ****/
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/**** Spiny 67 ****/
    SmoothDendrite[23] connect SpinyDendrite[752](0),1
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    SpinyDendrite[753] connect SpinyDendrite[754](0),1
    SpinyDendrite[754] {nseg=1 L=16 diam=1 }

    SpinyDendrite[753] connect SpinyDendrite[755](0),1
    SpinyDendrite[755] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[752] connect SpinyDendrite[756](0),1
    SpinyDendrite[756] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[756] connect SpinyDendrite[757](0),1
    SpinyDendrite[757] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[756] connect SpinyDendrite[758](0),1
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    SpinyDendrite[758] connect SpinyDendrite[759](0),1
    SpinyDendrite[759] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[758] connect SpinyDendrite[760](0),1
    SpinyDendrite[760] {nseg=1 L=14 diam=1 }


/**** Spiny 68 ****/
    SmoothDendrite[24] connect SpinyDendrite[761](0),1
    SpinyDendrite[761] {nseg=1 L=8 diam=2 }

    SpinyDendrite[761] connect SpinyDendrite[762](0),1
    SpinyDendrite[762] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[762] connect SpinyDendrite[763](0),1
    SpinyDendrite[763] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[763] connect SpinyDendrite[764](0),1
    SpinyDendrite[764] {nseg=1 L=20 diam=1 }

    SpinyDendrite[763] connect SpinyDendrite[765](0),1
    SpinyDendrite[765] {nseg=1 L=25 diam=1 }

    SpinyDendrite[762] connect SpinyDendrite[766](0),1
    SpinyDendrite[766] {nseg=1 L=24 diam=1 }

    SpinyDendrite[761] connect SpinyDendrite[767](0),1
    SpinyDendrite[767] {nseg=1 L=4 diam=2 }

    SpinyDendrite[767] connect SpinyDendrite[768](0),1
    SpinyDendrite[768] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[768] connect SpinyDendrite[769](0),1
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    SpinyDendrite[769] connect SpinyDendrite[770](0),1
    SpinyDendrite[770] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[770] connect SpinyDendrite[771](0),1
    SpinyDendrite[771] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[770] connect SpinyDendrite[772](0),1
    SpinyDendrite[772] {nseg=1 L=48 diam=1 }

    SpinyDendrite[768] connect SpinyDendrite[773](0),1
    SpinyDendrite[773] {nseg=1 L=14 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[769] connect SpinyDendrite[774](0),1
    SpinyDendrite[774] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[767] connect SpinyDendrite[775](0),1
    SpinyDendrite[775] {nseg=1 L=22 diam=2 }

    SpinyDendrite[775] connect SpinyDendrite[776](0),1
    SpinyDendrite[776] {nseg=1 L=28 diam=1 }

    SpinyDendrite[775] connect SpinyDendrite[777](0),1
    SpinyDendrite[777] {nseg=1 L=3 diam=2 }

    SpinyDendrite[777] connect SpinyDendrite[778](0),1
    SpinyDendrite[778] {nseg=1 L=23 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[778] connect SpinyDendrite[779](0),1
    SpinyDendrite[779] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
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/**** Spiny 72 ****/
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/**** Spiny 75 ****/
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    SpinyDendrite[828] connect SpinyDendrite[834](0),1
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    SpinyDendrite[838] connect SpinyDendrite[839](0),1
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 /**** Spiny 76 ****/
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    SpinyDendrite[845] connect SpinyDendrite[846](0),1
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    SpinyDendrite[845] connect SpinyDendrite[847](0),1
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    SpinyDendrite[847] connect SpinyDendrite[848](0),1
    SpinyDendrite[848] {nseg=1 L=17 diam=1 }

    SpinyDendrite[847] connect SpinyDendrite[849](0),1
    SpinyDendrite[849] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 77 ****/
    SmoothDendrite[11] connect SpinyDendrite[850](0),1
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    SpinyDendrite[854] connect SpinyDendrite[856](0),1
    SpinyDendrite[856] {nseg=1 L=1 diam=2 }

    SpinyDendrite[856] connect SpinyDendrite[857](0),1
    SpinyDendrite[857] {nseg=1 L=40 diam=1 }

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    SpinyDendrite[858] connect SpinyDendrite[862](0),1
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    SpinyDendrite[862] connect SpinyDendrite[863](0),1
    SpinyDendrite[863] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[862] connect SpinyDendrite[864](0),1
    SpinyDendrite[864] {nseg=1 L=19 diam=1 }


/**** Spiny 78 ****/
    SmoothDendrite[10] connect SpinyDendrite[865](0),1
    SpinyDendrite[865] {nseg=1 L=10 diam=2 }

    SpinyDendrite[865] connect SpinyDendrite[866](0),1
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    SpinyDendrite[867] connect SpinyDendrite[868](0),1
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    SpinyDendrite[868] connect SpinyDendrite[869](0),1
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    SpinyDendrite[870] {nseg=1 L=9 diam=1 }

    SpinyDendrite[869] connect SpinyDendrite[871](0),1
    SpinyDendrite[871] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[868] connect SpinyDendrite[872](0),1
    SpinyDendrite[872] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[867] connect SpinyDendrite[873](0),1
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    SpinyDendrite[873] connect SpinyDendrite[874](0),1
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    SpinyDendrite[874] connect SpinyDendrite[875](0),1
    SpinyDendrite[875] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[874] connect SpinyDendrite[876](0),1
    SpinyDendrite[876] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[873] connect SpinyDendrite[877](0),1
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    SpinyDendrite[877] connect SpinyDendrite[878](0),1
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    SpinyDendrite[877] connect SpinyDendrite[879](0),1
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/**** Spiny 79 ****/
    SmoothDendrite[10] connect SpinyDendrite[880](0),1
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    SpinyDendrite[880] connect SpinyDendrite[881](0),1
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    SpinyDendrite[881] connect SpinyDendrite[882](0),1
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    SpinyDendrite[882] connect SpinyDendrite[883](0),1
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    SpinyDendrite[882] connect SpinyDendrite[884](0),1
    SpinyDendrite[884] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[881] connect SpinyDendrite[885](0),1
    SpinyDendrite[885] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[880] connect SpinyDendrite[886](0),1
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    SpinyDendrite[886] connect SpinyDendrite[887](0),1
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    SpinyDendrite[887] connect SpinyDendrite[888](0),1
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    SpinyDendrite[887] connect SpinyDendrite[889](0),1
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    SpinyDendrite[886] connect SpinyDendrite[890](0),1
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    SpinyDendrite[890] connect SpinyDendrite[891](0),1
    SpinyDendrite[891] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[890] connect SpinyDendrite[892](0),1
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/**** Spiny 80 ****/
    SmoothDendrite[8] connect SpinyDendrite[893](0),1
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    SpinyDendrite[893] connect SpinyDendrite[894](0),1
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    SpinyDendrite[894] connect SpinyDendrite[895](0),1
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    SpinyDendrite[894] connect SpinyDendrite[896](0),1
    SpinyDendrite[896] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[893] connect SpinyDendrite[897](0),1
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    SpinyDendrite[897] connect SpinyDendrite[898](0),1
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    SpinyDendrite[897] connect SpinyDendrite[899](0),1
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    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[900](0),1
    SpinyDendrite[900] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[901](0),1
    SpinyDendrite[901] {nseg=1 L=10 diam=1 }


/**** Spiny 81 ****/
    SmoothDendrite[8] connect SpinyDendrite[902](0),1
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    SpinyDendrite[902] connect SpinyDendrite[903](0),1
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    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[904](0),1
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    SpinyDendrite[904] connect SpinyDendrite[905](0),1
    SpinyDendrite[905] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[906](0),1
    SpinyDendrite[906] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[907](0),1
    SpinyDendrite[907] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[908](0),1
    SpinyDendrite[908] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[904] connect SpinyDendrite[909](0),1
    SpinyDendrite[909] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[902] connect SpinyDendrite[910](0),1
    SpinyDendrite[910] {nseg=1 L=5 diam=2 }

    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[911](0),1
    SpinyDendrite[911] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[912](0),1
    SpinyDendrite[912] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[913](0),1
    SpinyDendrite[913] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[914](0),1
    SpinyDendrite[914] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[915](0),1
    SpinyDendrite[915] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[916](0),1
    SpinyDendrite[916] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[916] connect SpinyDendrite[917](0),1
    SpinyDendrite[917] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[916] connect SpinyDendrite[918](0),1
    SpinyDendrite[918] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[918] connect SpinyDendrite[919](0),1
    SpinyDendrite[919] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[918] connect SpinyDendrite[920](0),1
    SpinyDendrite[920] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[920] connect SpinyDendrite[921](0),1
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    SpinyDendrite[920] connect SpinyDendrite[922](0),1
    SpinyDendrite[922] {nseg=1 L=7 diam=1 }


/**** Spiny 82 ****/
    SmoothDendrite[4] connect SpinyDendrite[923](0),1
    SpinyDendrite[923] {nseg=1 L=28 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[923] connect SpinyDendrite[924](0),1
    SpinyDendrite[924] {nseg=1 L=18 diam=1 }

    SpinyDendrite[923] connect SpinyDendrite[925](0),1
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    SpinyDendrite[925] connect SpinyDendrite[926](0),1
    SpinyDendrite[926] {nseg=1 L=10 diam=1 }

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/**** Spiny 84 ****/
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/**** Spiny 85 ****/
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/**** Spiny 86 ****/
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    SpinyDendrite[999] connect SpinyDendrite[1000](0),1
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    SpinyDendrite[999] connect SpinyDendrite[1001](0),1
    SpinyDendrite[1001] {nseg=1 L=5 diam=1 }


    for i=0,1001 SpinyDendrite[i]   {cm=1.5
         insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0.0015
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0.008
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         insert KC3 gkbar_KC3  = 0.06
         insert K23
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}
    Spine {cm=0.8
         insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0.0015
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0.008
         insert Khh gkbar_Khh = 0.0006
         insert KM  gkbar_KM  = 0.00001
         insert KA  gkbar_KA  = 0.08
         insert KD  gkbar_KD  = 0.09
         insert KC3 gkbar_KC3  = 0.06
         insert K23
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}

global_ra = 250
set_ra()
celsius = 37
  


nrnmainmenu()		/* shows the main panel window on the screen */