Cerebellar purkinje cell: K and Ca channels regulate APs (Miyasho et al 2001)

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We adopted De Schutter and Bower's model as the starting point, then modified the descriptions of several ion channels, such as the P-type Ca channel and the delayed rectifier K channel, and added class-E Ca channels and D-type K channels to the model. Our new model reproduces most of our experimental results and supports the conclusions of our experimental study that class-E Ca channels and D-type K channels are present and functioning in the dendrites of Purkinje neurons.
1 . Miyasho T, Takagi H, Suzuki H, Watanabe S, Inoue M, Kudo Y, Miyakawa H (2001) Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons: a modeling study. Brain Res 891:106-15 [PubMed]
Citations  Citation Browser
Model Information (Click on a link to find other models with that property)
Model Type: Neuron or other electrically excitable cell;
Brain Region(s)/Organism:
Cell Type(s): Cerebellum Purkinje GABA cell;
Channel(s): I Na,p; I Na,t; I T low threshold; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium; I A, slow; I_KD;
Gap Junctions:
Simulation Environment: NEURON;
Model Concept(s): Action Potential Initiation; Activity Patterns; Dendritic Action Potentials; Bursting; Active Dendrites; Influence of Dendritic Geometry; Detailed Neuronal Models; Action Potentials; Calcium dynamics;
Implementer(s): Miyakawa, H [Miyakawa at ls.toyaku.ac.jp];
Search NeuronDB for information about:  Cerebellum Purkinje GABA cell; I Na,p; I Na,t; I T low threshold; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium; I A, slow; I_KD;
CaE.mod *
CalciumP.mod *
CaP.mod *
CaP2.mod *
CaT.mod *
K2.mod *
K22.mod *
K23.mod *
KA.mod *
KC.mod *
KC2.mod *
KC3.mod *
KD.mod *
Kdr.mod *
Kh.mod *
Khh.mod *
KM.mod *
Leak.mod *
NaF.mod *
NaP.mod *
A hoc file for a cerebellar Purkinje neuron.
Coded by MIYASHO Tsugumichi and MIYAKAWA Hiroyoshi.
This model runs on NEURON (version 3.2.3).
Description of this model can be found in 
"Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate
Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons : a modeling study"
(T. Miyasho et al., Brain Res 891, 2001, 106-115)

Morphology of the cell was taken from a paper by D.P.Shelton (Neuroscience 14, 1985, 111-131).
Most of the channels despriptions were taken from a paper by E.De.Shutter and 
J.M.Bower. (J. Neurophysiol., 71, 1994, 375-400)



create soma, SmoothDendrite[NumSmoothDendrite], SpinyDendrite[NumSpinyDendrite]
access soma
    soma connect SmoothDendrite[0](0),1
    soma	      {nseg=1 L=22 diam=22 }
    SmoothDendrite[0] {nseg=1 L=18 diam=4 }
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[1](0),1
    SmoothDendrite[1] {nseg=1 L=39 diam=4 }
    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[2](0),1
    SmoothDendrite[2] {nseg=1 L=12 diam=2 }
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[3](0),1
    SmoothDendrite[3] {nseg=1 L=7 diam=2 }
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[4](0),1
    SmoothDendrite[4] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[4] connect SmoothDendrite[5](0),1
    SmoothDendrite[5] {nseg=1 L=10 diam=2 }

    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[6](0),1
    SmoothDendrite[6] {nseg=1 L=10 diam=5 }
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[7](0),1
    SmoothDendrite[7] {nseg=1 L=37 diam=4 }
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[8](0),1
    SmoothDendrite[8] {nseg=1 L=2 diam=4 }
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[9](0),1
    SmoothDendrite[9] {nseg=1 L=15 diam=4 }
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[10](0),1
    SmoothDendrite[10] {nseg=1 L=4 diam=2 }
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[11](0),1
    SmoothDendrite[11] {nseg=1 L=2 diam=4 }
    SmoothDendrite[11] connect SmoothDendrite[12](0),1
    SmoothDendrite[12] {nseg=1 L=7 diam=4 }
    SmoothDendrite[12] connect SmoothDendrite[13](0),1
    SmoothDendrite[13] {nseg=1 L=2 diam=4 }
    SmoothDendrite[13] connect SmoothDendrite[14](0),1
    SmoothDendrite[14] {nseg=1 L=32 diam=4 }
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[15](0),1
    SmoothDendrite[15] {nseg=1 L=11 diam=3 }
    SmoothDendrite[17] connect SmoothDendrite[16](0),1
    SmoothDendrite[16] {nseg=1 L=3 diam=2 }
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[17](0),1
    SmoothDendrite[17] {nseg=1 L=3 diam=2 }
    SmoothDendrite[15] connect SmoothDendrite[18](0),1
    SmoothDendrite[18] {nseg=1 L=12 diam=3 }
    SmoothDendrite[18] connect SmoothDendrite[19](0),1
    SmoothDendrite[19] {nseg=1 L=8 diam=3 }
    SmoothDendrite[19] connect SmoothDendrite[20](0),1
    SmoothDendrite[20] {nseg=1 L=3 diam=2 }
    SmoothDendrite[20] connect SmoothDendrite[21](0),1
    SmoothDendrite[21] {nseg=1 L=6 diam=2 }
    SmoothDendrite[21] connect SmoothDendrite[22](0),1
    SmoothDendrite[22] {nseg=1 L=27 diam=2 }
    SmoothDendrite[22] connect SmoothDendrite[23](0),1
    SmoothDendrite[23] {nseg=1 L=5 diam=2 }
    SmoothDendrite[23] connect SmoothDendrite[24](0),1
    SmoothDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[25](0),1
    SmoothDendrite[25] {nseg=1 L=10 diam=5 }
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[26](0),1
    SmoothDendrite[26] {nseg=1 L=12 diam=2 }
    SmoothDendrite[26] connect SmoothDendrite[27](0),1
    SmoothDendrite[27] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[27] connect SmoothDendrite[28](0),1
    SmoothDendrite[28] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[28] connect SmoothDendrite[29](0),1
    SmoothDendrite[29] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[30](0),1
    SmoothDendrite[30] {nseg=1 L=12 diam=5 }
    SmoothDendrite[30] connect SmoothDendrite[31](0),1
    SmoothDendrite[31] {nseg=1 L=6 diam=5 }

    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[32](0),1
    SmoothDendrite[32] {nseg=1 L=6 diam=2 }
    SmoothDendrite[32] connect SmoothDendrite[33](0),1
    SmoothDendrite[33] {nseg=1 L=13 diam=2 }
    SmoothDendrite[33] connect SmoothDendrite[34](0),1
    SmoothDendrite[34] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[35](0),1
    SmoothDendrite[35] {nseg=1 L=22 diam=4 }
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[36](0),1
    SmoothDendrite[36] {nseg=1 L=4 diam=2 }
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[37](0),1
    SmoothDendrite[37] {nseg=1 L=4 diam=4 }
    SmoothDendrite[37] connect SmoothDendrite[38](0),1
    SmoothDendrite[38] {nseg=1 L=20 diam=4 }
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[39](0),1
    SmoothDendrite[39] {nseg=1 L=23 diam=1 }
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[40](0),1
    SmoothDendrite[40] {nseg=1 L=6 diam=4 }
    SmoothDendrite[40] connect SmoothDendrite[41](0),1
    SmoothDendrite[41] {nseg=1 L=4 diam=4 }
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[42](0),1
    SmoothDendrite[42] {nseg=1 L=1 diam=2 }
    SmoothDendrite[42] connect SmoothDendrite[43](0),1
    SmoothDendrite[43] {nseg=1 L=3 diam=2 }
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[44](0),1
    SmoothDendrite[44] {nseg=1 L=18 diam=3 }
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[45](0),1
    SmoothDendrite[45] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[45] connect SmoothDendrite[46](0),1
    SmoothDendrite[46] {nseg=1 L=20 diam=2 }
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[47](0),1
    SmoothDendrite[47] {nseg=1 L=8 diam=3 }
    SmoothDendrite[47] connect SmoothDendrite[48](0),1
    SmoothDendrite[48] {nseg=1 L=5 diam=3 }
    SmoothDendrite[48] connect SmoothDendrite[49](0),1
    SmoothDendrite[49] {nseg=1 L=9 diam=2 }
    SmoothDendrite[49] connect SmoothDendrite[50](0),1
    SmoothDendrite[50] {nseg=1 L=4 diam=2 }
    SmoothDendrite[50] connect SmoothDendrite[51](0),1
    SmoothDendrite[51] {nseg=1 L=6 diam=2 }
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[52](0),1
    SmoothDendrite[52] {nseg=1 L=22 diam=4 }
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[53](0),1
    SmoothDendrite[53] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[53] connect SmoothDendrite[54](0),1
    SmoothDendrite[54] {nseg=1 L=18 diam=2 }
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[55](0),1
    SmoothDendrite[55] {nseg=1 L=22 diam=6 }
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[56](0),1
    SmoothDendrite[56] {nseg=1 L=8 diam=2 }
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[57](0),1
    SmoothDendrite[57] {nseg=1 L=2 diam=6 }
    SmoothDendrite[57] connect SmoothDendrite[58](0),1
    SmoothDendrite[58] {nseg=1 L=3 diam=5 }
    SmoothDendrite[58] connect SmoothDendrite[59](0),1
    SmoothDendrite[59] {nseg=1 L=3 diam=6 }
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[60](0),1
    SmoothDendrite[60] {nseg=1 L=8 diam=2 }
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[61](0),1
    SmoothDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=6 }
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[62](0),1
    SmoothDendrite[62] {nseg=1 L=44 diam=2 }
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[63](0),1
    SmoothDendrite[63] {nseg=1 L=12 diam=2 }
    SmoothDendrite[63] connect SmoothDendrite[64](0),1
    SmoothDendrite[64] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[65](0),1
    SmoothDendrite[65] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[65] connect SmoothDendrite[66](0),1
    SmoothDendrite[66] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[66] connect SmoothDendrite[67](0),1
    SmoothDendrite[67] {nseg=1 L=13 diam=1 }
    SmoothDendrite[67] connect SmoothDendrite[68](0),1
    SmoothDendrite[68] {nseg=1 L=4 diam=1 }
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[69](0),1
    SmoothDendrite[69] {nseg=1 L=10 diam=6 }
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[70](0),1
    SmoothDendrite[70] {nseg=1 L=4 diam=3 }
    SmoothDendrite[70] connect SmoothDendrite[71](0),1
    SmoothDendrite[71] {nseg=1 L=4 diam=3 }
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[72](0),1
    SmoothDendrite[72] {nseg=1 L=2 diam=6 }
    SmoothDendrite[72] connect SmoothDendrite[73](0),1
    SmoothDendrite[73] {nseg=1 L=24 diam=5 }
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[74](0),1
    SmoothDendrite[74] {nseg=1 L=52 diam=2 }
    SmoothDendrite[74] connect SmoothDendrite[75](0),1
    SmoothDendrite[75] {nseg=1 L=16 diam=2 }
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[76](0),1
    SmoothDendrite[76] {nseg=1 L=14 diam=4 }
    SmoothDendrite[76] connect SmoothDendrite[77](0),1
    SmoothDendrite[77] {nseg=1 L=2 diam=4 }
    SmoothDendrite[77] connect SmoothDendrite[78](0),1
    SmoothDendrite[78] {nseg=1 L=14 diam=4 }
    SmoothDendrite[78] connect SmoothDendrite[79](0),1
    SmoothDendrite[79] {nseg=1 L=24 diam=4 }
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[80](0),1
    SmoothDendrite[80] {nseg=1 L=6 diam=2 }
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[81](0),1
    SmoothDendrite[81] {nseg=1 L=8 diam=2 }
    SmoothDendrite[81] connect SmoothDendrite[82](0),1
    SmoothDendrite[82] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SmoothDendrite[82] connect SmoothDendrite[83](0),1
    SmoothDendrite[83] {nseg=1 L=6 diam=2 }

    SmoothDendrite[83] connect SmoothDendrite[84](0),1
    SmoothDendrite[84] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    soma               {cm=0.8    
         insert Leak gl_Leak = 0.00006 el_Leak = -80
	 insert NaF  gnabar_NaF = 10
         insert NaP
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.0005
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0
         insert Khh
         insert KM
         insert KA 
         insert KD  gkbar_KD  = 0
         insert Kh   gkbar_Kh = 0.0005
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
    for i=0,84 SmoothDendrite[i]  {cm=0.8  
         insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0.0015
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0.008
         insert Khh gkbar_Khh = 0.0006
         insert KM  gkbar_KM  = 0.00001
         insert KA  gkbar_KA  = 0.08
         insert KD  gkbar_KD  = 0.09
         insert KC3 gkbar_KC3  = 0.06
         insert K23
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 

/**** Spiny 1 ****/
    SmoothDendrite[53] connect SpinyDendrite[0](0),1
    SpinyDendrite[0] {nseg=1 L=8 diam=1 }

/**** Spiny 2 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[1](0),1
    SpinyDendrite[1] {nseg=1 L=9 diam=2 }
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[2](0),1
    SpinyDendrite[2] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[3](0),1
    SpinyDendrite[3] {nseg=1 L=8 diam=1 }
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[4](0),1
    SpinyDendrite[4] {nseg=1 L=10 diam=1 }
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[5](0),1
    SpinyDendrite[5] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[6](0),1
    SpinyDendrite[6] {nseg=1 L=5 diam=1.0 }
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[7](0),1
    SpinyDendrite[7] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
/**** Spiny 3 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[8](0),1
    SpinyDendrite[8] {nseg=1 L=4 diam=2 }
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[9](0),1
    SpinyDendrite[9] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[10](0),1
    SpinyDendrite[10] {nseg=1 L=5 diam=2.0 }
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[11](0),1
    SpinyDendrite[11] {nseg=1 L=10 diam=1.0 }
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[12](0),1
    SpinyDendrite[12] {nseg=1 L=2 diam=2.0 }
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[13](0),1
    SpinyDendrite[13] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[14](0),1
    SpinyDendrite[14] {nseg=1 L=7 diam=1.0 }
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[15](0),1
    SpinyDendrite[15] {nseg=1 L=6 diam=1 }
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[16](0),1
    SpinyDendrite[16] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[17](0),1
    SpinyDendrite[17] {nseg=1 L=10 diam=1 }
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[18](0),1
    SpinyDendrite[18] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[19](0),1
    SpinyDendrite[19] {nseg=1 L=3 diam=1 }
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[20](0),1
    SpinyDendrite[20] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[21](0),1
    SpinyDendrite[21] {nseg=1 L=5 diam=1 }
    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[22](0),1
    SpinyDendrite[22] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[23](0),1
    SpinyDendrite[23] {nseg=1 L=8 diam=1 }
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[24](0),1
    SpinyDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[25](0),1
    SpinyDendrite[25] {nseg=1 L=2 diam=1 }
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[26](0),1
    SpinyDendrite[26] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[27](0),1
    SpinyDendrite[27] {nseg=1 L=5 diam=1 }
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[28](0),1
    SpinyDendrite[28] {nseg=1 L=4 diam=1 }

/**** Spiny 4 ****/
    SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[29](0),1
    SpinyDendrite[29] {nseg=1 L=11 diam=2 }
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[30](0),1
    SpinyDendrite[30] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[31](0),1
    SpinyDendrite[31] {nseg=1 L=10 diam=1 }
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[32](0),1
    SpinyDendrite[32] {nseg=1 L=10 diam=1 }
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[33](0),1
    SpinyDendrite[33] {nseg=1 L=2 diam=2 }
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[34](0),1
    SpinyDendrite[34] {nseg=1 L=18 diam=1 }
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[35](0),1
    SpinyDendrite[35] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[36](0),1
    SpinyDendrite[36] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[37](0),1
    SpinyDendrite[37] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[38](0),1
    SpinyDendrite[38] {nseg=1 L=18 diam=1 }
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[39](0),1
    SpinyDendrite[39] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[40](0),1
    SpinyDendrite[40] {nseg=1 L=7 diam=1 }
    SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[41](0),1
    SpinyDendrite[41] {nseg=1 L=6 diam=2 }
    SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[42](0),1
    SpinyDendrite[42] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[43](0),1
    SpinyDendrite[43] {nseg=1 L=6 diam=1 }
    SpinyDendrite[42] connect SpinyDendrite[44](0),1
    SpinyDendrite[44] {nseg=1 L=6 diam=1 }
    SpinyDendrite[41] connect SpinyDendrite[45](0),1
    SpinyDendrite[45] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[46](0),1
    SpinyDendrite[46] {nseg=1 L=8 diam=1 }
    SpinyDendrite[45] connect SpinyDendrite[47](0),1
    SpinyDendrite[47] {nseg=1 L=7 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[46] connect SpinyDendrite[48](0),1
    SpinyDendrite[48] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[47] connect SpinyDendrite[49](0),1
    SpinyDendrite[49] {nseg=1 L=6 diam=1 }

/**** Spiny 5 ****/
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/**** Spiny 6 ****/
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/**** Spiny 7 ****/
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/**** Spiny 8 ****/
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/**** Spiny 9 ****/
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/**** Spiny 10 ****/
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/**** Spiny 11 ****/
    SmoothDendrite[72] connect SpinyDendrite[100](0),1
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    SpinyDendrite[105] connect SpinyDendrite[107](0),1
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/**** Spiny 12 ****/
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    SpinyDendrite[125] connect SpinyDendrite[129](0),1
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    SpinyDendrite[129] connect SpinyDendrite[131](0),1
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    SpinyDendrite[131] connect SpinyDendrite[132](0),1
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    SpinyDendrite[133] {nseg=1 L=5 diam=1 }

/**** Spiny 13 ****/
    SmoothDendrite[78] connect SpinyDendrite[134](0),1
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    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[140](0),1
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    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[141](0),1
    SpinyDendrite[141] {nseg=1 L=13 diam=1 }
    SpinyDendrite[138] connect SpinyDendrite[142](0),1
    SpinyDendrite[142] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[143](0),1
    SpinyDendrite[143] {nseg=1 L=12 diam=1 }
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[144](0),1
    SpinyDendrite[144] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[144] connect SpinyDendrite[145](0),1
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    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[147](0),1
    SpinyDendrite[147] {nseg=1 L=8 diam=1 }
    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[148](0),1
    SpinyDendrite[148] {nseg=1 L=6 diam=1 }
/**** Spiny 14 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[149](0),1
    SpinyDendrite[149] {nseg=1 L=4 diam=2 }
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[150](0),1
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    SpinyDendrite[150] connect SpinyDendrite[151](0),1
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    SpinyDendrite[152] {nseg=1 L=8 diam=1 }
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[153](0),1
    SpinyDendrite[153] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[154](0),1
    SpinyDendrite[154] {nseg=1 L=18 diam=1 }
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[155](0),1
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    SpinyDendrite[155] connect SpinyDendrite[156](0),1
    SpinyDendrite[156] {nseg=1 L=9 diam=1}
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    SpinyDendrite[157] connect SpinyDendrite[158](0),1
    SpinyDendrite[158] {nseg=1 L=12 diam=1 }
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/**** Spiny 15 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[160](0),1
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    SpinyDendrite[162] {nseg=1 L=3 diam=2 }
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[163](0),1
    SpinyDendrite[163] {nseg=1 L=13 diam=1 }
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[164](0),1
    SpinyDendrite[164] {nseg=1 L=10 diam=2 }
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    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[166](0),1
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    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[167](0),1
    SpinyDendrite[167] {nseg=1 L=5 diam=1 }
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    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[169](0),1
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    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[170](0),1
    SpinyDendrite[170] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[171](0),1
    SpinyDendrite[171] {nseg=1 L=4 diam=1 }
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[172](0),1
    SpinyDendrite[172] {nseg=1 L=5 diam=1 }

/**** Spiny 16 ****/
    SmoothDendrite[81] connect SpinyDendrite[173](0),1
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    SpinyDendrite[173] connect SpinyDendrite[175](0),1
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/**** Spiny 17 ****/
    SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[176](0),1
    SpinyDendrite[176] {nseg=1 L=8 diam=2 }
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[177](0),1
    SpinyDendrite[177] {nseg=1 L=40 diam=1 }
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[178](0),1
    SpinyDendrite[178] {nseg=1 L=9 diam=2 }
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[179](0),1
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    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[180](0),1
    SpinyDendrite[180] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[181](0),1
    SpinyDendrite[181] {nseg=1 L=17 diam=1 }
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[182](0),1
    SpinyDendrite[182] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[183](0),1
    SpinyDendrite[183] {nseg=1 L=10 diam=1 }
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[184](0),1
    SpinyDendrite[184] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[185](0),1
    SpinyDendrite[185] {nseg=1 L=22 diam=1 }
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[186](0),1
    SpinyDendrite[186] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[186] connect SpinyDendrite[187](0),1
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/**** Spiny 18 ****/
    SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[189](0),1
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    SpinyDendrite[197] connect SpinyDendrite[199](0),1
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/**** Spiny 19 ****/
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/**** Spiny 23 ****/
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/**** Spiny 24 ****/
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/**** Spiny 25 ****/
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/**** Spiny 26 ****/
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/**** Spiny 27 ****/
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/**** Spiny 29 ****/
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/**** Spiny 30 ****/
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/**** Spiny 31 ****/
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    SpinyDendrite[314] connect SpinyDendrite[320](0),1
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/**** Spiny 32 ****/
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/**** Spiny 40 ****/
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/**** Spiny 42 ****/
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/**** Spiny 44 ****/
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    SpinyDendrite[479] connect SpinyDendrite[481](0),1
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/**** Spiny 45 ****/
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    SpinyDendrite[492] connect SpinyDendrite[494](0),1
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/**** Spiny 46 ****/
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/**** Spiny 52 ****/
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/**** Spiny 53 ****/
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/**** Spiny 54 ****/
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/**** Spiny 55 ****/
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/**** Spiny 56 ****/
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/**** Spiny 57 ****/
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    SpinyDendrite[628] connect SpinyDendrite[629](0),1
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    SpinyDendrite[628] connect SpinyDendrite[630](0),1
    SpinyDendrite[630] {nseg=1 L=25 diam=1 }

    SpinyDendrite[627] connect SpinyDendrite[631](0),1
    SpinyDendrite[631] {nseg=1 L=16 diam=1 }

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    SpinyDendrite[632] connect SpinyDendrite[633](0),1
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/**** Spiny 58 ****/
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/**** Spiny 68 ****/
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/**** Spiny 69 ****/
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/**** Spiny 70 ****/
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/**** Spiny 73 ****/
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/**** Spiny 74 ****/
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/**** Spiny 75 ****/
    SmoothDendrite[16] connect SpinyDendrite[828](0),1
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    SpinyDendrite[830] connect SpinyDendrite[831](0),1
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    SpinyDendrite[832] {nseg=1 L= diam=1 }

    SpinyDendrite[829] connect SpinyDendrite[833](0),1
    SpinyDendrite[833] {nseg=1 L= diam=1 }

    SpinyDendrite[828] connect SpinyDendrite[834](0),1
    SpinyDendrite[834] {nseg=1 L= diam=1.4 }

    SpinyDendrite[834] connect SpinyDendrite[835](0),1
    SpinyDendrite[835] {nseg=1 L= diam=1 }

    SpinyDendrite[834] connect SpinyDendrite[836](0),1
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    SpinyDendrite[836] connect SpinyDendrite[837](0),1
    SpinyDendrite[837] {nseg=1 L= diam=1 }

    SpinyDendrite[836] connect SpinyDendrite[838](0),1
    SpinyDendrite[838] {nseg=1 L= diam=1.4 }

    SpinyDendrite[838] connect SpinyDendrite[839](0),1
    SpinyDendrite[839] {nseg=1 L= diam=1 }

    SpinyDendrite[838] connect SpinyDendrite[840](0),1
    SpinyDendrite[840] {nseg=1 L= diam=1 }

 /**** Spiny 76 ****/
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    SpinyDendrite[842] connect SpinyDendrite[843](0),1
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    SpinyDendrite[845] connect SpinyDendrite[846](0),1
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    SpinyDendrite[845] connect SpinyDendrite[847](0),1
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    SpinyDendrite[847] connect SpinyDendrite[848](0),1
    SpinyDendrite[848] {nseg=1 L=17 diam=1 }

    SpinyDendrite[847] connect SpinyDendrite[849](0),1
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/**** Spiny 77 ****/
    SmoothDendrite[11] connect SpinyDendrite[850](0),1
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    SpinyDendrite[851] connect SpinyDendrite[852](0),1
    SpinyDendrite[852] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[851] connect SpinyDendrite[853](0),1
    SpinyDendrite[853] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[850] connect SpinyDendrite[854](0),1
    SpinyDendrite[854] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[854] connect SpinyDendrite[855](0),1
    SpinyDendrite[855] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[854] connect SpinyDendrite[856](0),1
    SpinyDendrite[856] {nseg=1 L=1 diam=2 }

    SpinyDendrite[856] connect SpinyDendrite[857](0),1
    SpinyDendrite[857] {nseg=1 L=40 diam=1 }

    SpinyDendrite[856] connect SpinyDendrite[858](0),1
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    SpinyDendrite[858] connect SpinyDendrite[859](0),1
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    SpinyDendrite[859] connect SpinyDendrite[860](0),1
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    SpinyDendrite[858] connect SpinyDendrite[862](0),1
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    SpinyDendrite[862] connect SpinyDendrite[864](0),1
    SpinyDendrite[864] {nseg=1 L=19 diam=1 }

/**** Spiny 78 ****/
    SmoothDendrite[10] connect SpinyDendrite[865](0),1
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    SpinyDendrite[865] connect SpinyDendrite[866](0),1
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    SpinyDendrite[867] connect SpinyDendrite[868](0),1
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    SpinyDendrite[869] connect SpinyDendrite[870](0),1
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    SpinyDendrite[869] connect SpinyDendrite[871](0),1
    SpinyDendrite[871] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[868] connect SpinyDendrite[872](0),1
    SpinyDendrite[872] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[867] connect SpinyDendrite[873](0),1
    SpinyDendrite[873] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[873] connect SpinyDendrite[874](0),1
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    SpinyDendrite[874] connect SpinyDendrite[875](0),1
    SpinyDendrite[875] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[874] connect SpinyDendrite[876](0),1
    SpinyDendrite[876] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[873] connect SpinyDendrite[877](0),1
    SpinyDendrite[877] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[877] connect SpinyDendrite[878](0),1
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    SpinyDendrite[877] connect SpinyDendrite[879](0),1
    SpinyDendrite[879] {nseg=1 L=6 diam=1 }

/**** Spiny 79 ****/
    SmoothDendrite[10] connect SpinyDendrite[880](0),1
    SpinyDendrite[880] {nseg=1 L=10 diam=2 }

    SpinyDendrite[880] connect SpinyDendrite[881](0),1
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    SpinyDendrite[881] connect SpinyDendrite[882](0),1
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    SpinyDendrite[882] connect SpinyDendrite[883](0),1
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    SpinyDendrite[882] connect SpinyDendrite[884](0),1
    SpinyDendrite[884] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[881] connect SpinyDendrite[885](0),1
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    SpinyDendrite[880] connect SpinyDendrite[886](0),1
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    SpinyDendrite[886] connect SpinyDendrite[887](0),1
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    SpinyDendrite[887] connect SpinyDendrite[888](0),1
    SpinyDendrite[888] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[887] connect SpinyDendrite[889](0),1
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    SpinyDendrite[886] connect SpinyDendrite[890](0),1
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    SpinyDendrite[890] connect SpinyDendrite[891](0),1
    SpinyDendrite[891] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[890] connect SpinyDendrite[892](0),1
    SpinyDendrite[892] {nseg=1 L=12 diam=1 }

/**** Spiny 80 ****/
    SmoothDendrite[8] connect SpinyDendrite[893](0),1
    SpinyDendrite[893] {nseg=1 L=7 diam=2 }

    SpinyDendrite[893] connect SpinyDendrite[894](0),1
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    SpinyDendrite[894] connect SpinyDendrite[895](0),1
    SpinyDendrite[895] {nseg=1 L=13 diam=1 }

    SpinyDendrite[894] connect SpinyDendrite[896](0),1
    SpinyDendrite[896] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[893] connect SpinyDendrite[897](0),1
    SpinyDendrite[897] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[897] connect SpinyDendrite[898](0),1
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    SpinyDendrite[897] connect SpinyDendrite[899](0),1
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    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[900](0),1
    SpinyDendrite[900] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[901](0),1
    SpinyDendrite[901] {nseg=1 L=10 diam=1 }

/**** Spiny 81 ****/
    SmoothDendrite[8] connect SpinyDendrite[902](0),1
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    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[904](0),1
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    SpinyDendrite[904] connect SpinyDendrite[905](0),1
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    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[906](0),1
    SpinyDendrite[906] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[907](0),1
    SpinyDendrite[907] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[908](0),1
    SpinyDendrite[908] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[904] connect SpinyDendrite[909](0),1
    SpinyDendrite[909] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[902] connect SpinyDendrite[910](0),1
    SpinyDendrite[910] {nseg=1 L=5 diam=2 }

    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[911](0),1
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    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[912](0),1
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    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[913](0),1
    SpinyDendrite[913] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[914](0),1
    SpinyDendrite[914] {nseg=1 L=5 diam=1 }
    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[915](0),1
    SpinyDendrite[915] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[916](0),1
    SpinyDendrite[916] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[916] connect SpinyDendrite[917](0),1
    SpinyDendrite[917] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[916] connect SpinyDendrite[918](0),1
    SpinyDendrite[918] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[918] connect SpinyDendrite[919](0),1
    SpinyDendrite[919] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[918] connect SpinyDendrite[920](0),1
    SpinyDendrite[920] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
    SpinyDendrite[920] connect SpinyDendrite[921](0),1
    SpinyDendrite[921] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[920] connect SpinyDendrite[922](0),1
    SpinyDendrite[922] {nseg=1 L=7 diam=1 }

/**** Spiny 82 ****/
    SmoothDendrite[4] connect SpinyDendrite[923](0),1
    SpinyDendrite[923] {nseg=1 L=28 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[923] connect SpinyDendrite[924](0),1
    SpinyDendrite[924] {nseg=1 L=18 diam=1 }

    SpinyDendrite[923] connect SpinyDendrite[925](0),1
    SpinyDendrite[925] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[925] connect SpinyDendrite[926](0),1
    SpinyDendrite[926] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[925] connect SpinyDendrite[927](0),1
    SpinyDendrite[927] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[927] connect SpinyDendrite[928](0),1
    SpinyDendrite[928] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[927] connect SpinyDendrite[929](0),1
    SpinyDendrite[929] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[929] connect SpinyDendrite[930](0),1
    SpinyDendrite[930] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[929] connect SpinyDendrite[931](0),1
    SpinyDendrite[931] {nseg=1 L=4 diam=1 }

/**** Spiny 83 ****/
    SmoothDendrite[5] connect SpinyDendrite[932](0),1
    SpinyDendrite[932] {nseg=1 L=5 diam=2 }

    SpinyDendrite[932] connect SpinyDendrite[933](0),1
    SpinyDendrite[933] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[933] connect SpinyDendrite[934](0),1
    SpinyDendrite[934] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[933] connect SpinyDendrite[935](0),1
    SpinyDendrite[935] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[932] connect SpinyDendrite[936](0),1
    SpinyDendrite[936] {nseg=1 L=1 diam=2 }

    SpinyDendrite[936] connect SpinyDendrite[937](0),1
    SpinyDendrite[937] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[937] connect SpinyDendrite[938](0),1
    SpinyDendrite[938] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[938] connect SpinyDendrite[939](0),1
    SpinyDendrite[939] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[938] connect SpinyDendrite[940](0),1
    SpinyDendrite[940] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[937] connect SpinyDendrite[941](0),1
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		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 

global_ra = 250
celsius = 37

nrnmainmenu()		/* shows the main panel window on the screen */