oc>forall psection()
ET[0].soma { nseg=1 L=12.5 Ra=150
/*location 0 attached to cell 0*/
/* First segment only */
insert morphology { diam=20}
insert capacitance { cm=1.8}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
insert Exp2Syn { tau1=5 tau2=50 e=0}
insert IClamp { del=500 dur=1000 amp=0.05}
}
ET[0].priden { nseg=5 L=75 Ra=150
ET[0].soma connect ET[0].priden (0), 1
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=3}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
insert Ih { gkhbar_Ih=0.00024}
insert h_ion { eh=0}
}
ET[0].secden[0] { nseg=50 L=0.5 Ra=150
ET[0].soma connect ET[0].secden[0] (0), 0.5
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=2}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
}
ET[0].secden[1] { nseg=50 L=0.5 Ra=150
ET[0].soma connect ET[0].secden[1] (0), 0.5
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=2}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
}
ET[0].tuftden { nseg=10 L=100 Ra=150 rallbranch=10
ET[0].priden connect ET[0].tuftden (0), 1
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=1}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
insert Ih { gkhbar_Ih=0.00024}
insert h_ion { eh=0}
}
ET[0].hillock { nseg=3 L=2.5 Ra=150
ET[0].soma connect ET[0].hillock (0), 0
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=14.8611}
insert pas { g_pas=8.33333e-05 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=10 gbar_nax=0.04}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.004 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
}
ET[0].initialseg { nseg=3 L=15 Ra=150
ET[0].hillock connect ET[0].initialseg (0), 1
/* First segment only */
insert capacitance { cm=1.8}
insert morphology { diam=1.5}
insert pas { g_pas=0.001 e_pas=-65}
insert nax { sh_nax=0 gbar_nax=0.8}
insert na_ion { ena=50}
insert kamt { gbar_kamt=0.08 sha_kamt=9.9 shi_kamt=5.7 k_tauH_kamt=1 sh_tauH_kamt=0}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0.0001 q10_kdrmt=3}
insert k_ion { ek=-90}
}
oc>
These standalone ET cell simulation values were generated by running
nrngui et_rig.ses
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