setuptime = startsw()
{xopen("hoc/defvar.hoc")}
// load balancing implies several runs.
// 0) load balancing just plain off (but will read mcomplex.dat if exists)
// 1) create a mcomplex.dat file (only one cpu needed)
// 2) create single split balance.dat file (any number of cpus can be used)
// manually: run the balcomp program to create balance.ncpu files
// 3) run with single split load balancing on (ncpu corresponding to files from balcomp)
// add more for whole cell and multisplit load balancing
// 4) create whole cell load balance file
// 5) run with whole cell load balance file
// 6) create multisplit load balance information file
// 7) run using multisplit load balance
default_var("load_balance_phase", 0)
default_var("one_tenth_ncell", 0)
default_var("default_delay", 0.5)
default_var("ranseedbase", 1)
default_var("wholecell_prefix", "cxwhole")
default_var("multisplit_prefix", "cx")
default_var("multisplit_nhost", 256)
default_var("msoptfactor", 0.8)
default_var("nthread", 1)
default_var("savestatetest", 0)
default_var("use_gap", 1)
default_var("use_ectopic", 0)
default_var("use_inject", 1)
default_var("awake", 1)
default_var("use_traubexact", 0)
default_var("jordan_trace",1)
default_var("Figure", 0)
default_var("picrotoxin", 1)
default_var("NBQX", 1)
default_var("scale_NMDA_conductances", 1)
default_var("scale_TCR_output", 1)
default_var("jEFP1",1000)
default_var("jEFP2",2000)
default_var("spike_compress", 5)
default_var("cacheeffic", 1) // for multisplit it is always 1
default_var("multisend", 0)
default_var("selfevents", 0)
default_var("fakerank", -1)
default_var("fakenhost", -1)
default_var("parmset",3)
default_var("Control", 0)
if (parmset==1) {
default_var("e2e2",2)
default_var("e2e5",2)
default_var("e2e6",1)
default_var("e2i2",1)
default_var("e2i6",1)
default_var("e4e2",1)
default_var("e4e4",1)
default_var("e4e5",1)
default_var("e4e6",2)
default_var("e4i2",1)
default_var("e4i6",1)
default_var("e5e2",1)
default_var("e5e4",1)
default_var("e5e5",1)
default_var("e5e6",2)
default_var("e5i2",2)
default_var("e5i6",2)
default_var("e6e2",1)
default_var("e6e4",1)
default_var("e6e5",2)
default_var("e6e6",1)
default_var("e6i2",2)
default_var("e6i6",2)
default_var("e6rt",1)
default_var("e6tc",1)
default_var("i2e2",1)
default_var("i2e4",1)
default_var("i2e5",1)
default_var("i2e6",2)
default_var("i2i2",2)
default_var("i2i6",1)
default_var("i6e4",1)
default_var("i6e5",1)
default_var("i6e6",2)
default_var("i6i6",2)
default_var("rtrt",1)
default_var("rttc",2)
default_var("tce2",1)
default_var("tce4",2)
default_var("tce5",1)
default_var("tce6",1)
default_var("tci2",2)
default_var("tci6",1)
default_var("tcrt",1)
}
if (parmset==2) {
default_var("e2e2",2)
default_var("e2e5",2)
default_var("e2e6",1)
default_var("e2i2",1)
default_var("e2i6",1)
default_var("e4e2",1)
default_var("e4e4",1)
default_var("e4e5",2)
default_var("e4e6",1)
default_var("e4i2",2)
default_var("e4i6",1)
default_var("e5e2",1)
default_var("e5e4",1)
default_var("e5e5",1)
default_var("e5e6",1)
default_var("e5i2",2)
default_var("e5i6",2)
default_var("e6e2",2)
default_var("e6e4",1)
default_var("e6e5",1)
default_var("e6e6",1)
default_var("e6i2",2)
default_var("e6i6",2)
default_var("e6rt",2)
default_var("e6tc",2)
default_var("i2e2",2)
default_var("i2e4",1)
default_var("i2e5",1)
default_var("i2e6",1)
default_var("i2i2",2)
default_var("i2i6",2)
default_var("i6e4",1)
default_var("i6e5",2)
default_var("i6e6",2)
default_var("i6i6",2)
default_var("rtrt",2)
default_var("rttc",1)
default_var("tce2",1)
default_var("tce4",1)
default_var("tce5",1)
default_var("tce6",1)
default_var("tci2",1)
default_var("tci6",1)
default_var("tcrt",1)
}
if (parmset==3) {
default_var("e2e2",0)
default_var("e2e5",0)
default_var("e2e6",0)
default_var("e2i2",0)
default_var("e2i6",0)
default_var("e4e2",0)
default_var("e4e4",0)
default_var("e4e5",0)
default_var("e4e6",0)
default_var("e4i2",0)
default_var("e4i6",0)
default_var("e5e2",0)
default_var("e5e4",0)
default_var("e5e5",0)
default_var("e5e6",0)
default_var("e5i2",0)
default_var("e5i6",0)
default_var("e6e2",0)
default_var("e6e4",0)
default_var("e6e5",0)
default_var("e6e6",0)
default_var("e6i2",0)
default_var("e6i6",0)
default_var("e6rt",0)
default_var("e6tc",0)
default_var("i2e2",0)
default_var("i2e4",0)
default_var("i2e5",0)
default_var("i2e6",0)
default_var("i2i2",0)
default_var("i2i6",0)
default_var("i6e4",0)
default_var("i6e5",0)
default_var("i6e6",0)
default_var("i6i6",0)
default_var("rtrt",0)
default_var("rttc",0)
default_var("tce2",0)
default_var("tce4",0)
default_var("tce5",0)
default_var("tce6",0)
default_var("tci2",0)
default_var("tci6",0)
default_var("tcrt",0)
}
// midpoint set
if (parmset==4) {
default_var("e2e2",3)
default_var("e2e5",3)
default_var("e2e6",3)
default_var("e2i2",3)
default_var("e2i6",3)
default_var("e4e2",3)
default_var("e4e4",3)
default_var("e4e5",3)
default_var("e4e6",3)
default_var("e4i2",3)
default_var("e4i6",3)
default_var("e5e2",3)
default_var("e5e4",3)
default_var("e5e5",3)
default_var("e5e6",3)
default_var("e5i2",3)
default_var("e5i6",3)
default_var("e6e2",3)
default_var("e6e4",3)
default_var("e6e5",3)
default_var("e6e6",3)
default_var("e6i2",3)
default_var("e6i6",3)
default_var("e6rt",3)
default_var("e6tc",3)
default_var("i2e2",3)
default_var("i2e4",3)
default_var("i2e5",3)
default_var("i2e6",3)
default_var("i2i2",3)
default_var("i2i6",3)
default_var("i6e4",3)
default_var("i6e5",3)
default_var("i6e6",3)
default_var("i6i6",3)
default_var("rtrt",3)
default_var("rttc",3)
default_var("tce2",3)
default_var("tce4",3)
default_var("tce5",3)
default_var("tce6",3)
default_var("tci2",3)
default_var("tci6",3)
default_var("tcrt",3)
}
use_p2c_net_connections = 0 // not 0, requires p2c emitted map and compmap files
strdef varfn
if (Control==1) {
sprint(varfn, "control.dat")
} else {
sprint(varfn, "%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d.dat", e2e2,e2e5,e2e6,e2i2,e2i6,e4e2,e4e4,e4e5,e4e6,e4i2,e4i6,e5e2,e5e4,e5e5,e5e6,e5i2,e5i6,e6e2,e6e4,e6e5,e6e6,e6i2,e6i6,i2e2,i2e4,i2e5,i2e6,i2i2,i2i6,i6e4,i6e5,i6e6,i6i6)
}
objref tfn[12]
strdef trace
objref Jtrace[12]
if (jordan_trace == 1){
{sprint(trace, "data/traces/trace_suppyrRS_%s",varfn)}
tfn[0] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_suppyrFRB_%s",varfn)}
tfn[1] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_supaxax_%s",varfn)}
tfn[2] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_spinstell_%s",varfn)}
tfn[3] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_tuftIB_%s",varfn)}
tfn[4] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_tuftRS_%s",varfn)}
tfn[5] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_nontuftRS_%s",varfn)}
tfn[6] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_deepaxax_%s",varfn)}
tfn[7] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_deepbask_%s",varfn)}
tfn[8] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_supbask_%s",varfn)}
tfn[9] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_supLTS_%s",varfn)}
tfn[10] = new String(trace)
{sprint(trace, "data/traces/trace_deepLTS_%s",varfn)}
tfn[11] = new String(trace)
for i = 0, 11 {
Jtrace[i] = new Vector()
}
}
objref EF[10]
for i = 0, 9 {
EF[i] = new Vector()
}
objref tvec, EFtvec
tvec = new Vector()
EFtvec = new Vector()
double efmm[10]
{localloadfile("manage_setup.hoc")}
//{localloadfile("syndump.hoc")}
// quit()
steps_per_ms = 40
dt = .025
secondorder = 2
default_var("mytstop", 3000)
tstop = mytstop
//{load_file("balanal.hoc")}
//if (pc.nhost >= 128) {thread_per_piece()}
if (0) { pc.runworker() pc.done() quit() }
//{finitialize(-65) cvode_local(1) cvode.atol(1e-4)} // the finitialze avoids /0 in BREAKPOINT
prun()
//if (pc.nhost >= 128) {balanalfile("balanal.dat")}
endtime = startsw()
if (pc.id == 0) { print "tstop = ", tstop }
if (pc.id == 0) { print "RunTime: ", runtime }
//{localloadfile("prcellstate.hoc")}
proc pcs() {local spgid
spgid = thishost_gid($1)
if (spgid >= 0) prcellstate(load_balance_phase, spgid)
pc.runworker() pc.done() quit()
}
//pcs(103)
// if (pc.nhost > 5) {cvode_active(1)} // to count equations
{pc.runworker()}
print "Maximum integration interval: ", mindelay()
getstat()
prhist()
//print_spike_stat_info()
{pc.done()}
perf2file()
endtime = startsw() - endtime
print "endtime ", endtime
if (!serial) { quit() }
