Cerebellar purkinje cell: K and Ca channels regulate APs (Miyasho et al 2001)

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Accession:17664
We adopted De Schutter and Bower's model as the starting point, then modified the descriptions of several ion channels, such as the P-type Ca channel and the delayed rectifier K channel, and added class-E Ca channels and D-type K channels to the model. Our new model reproduces most of our experimental results and supports the conclusions of our experimental study that class-E Ca channels and D-type K channels are present and functioning in the dendrites of Purkinje neurons.
Reference:
1 . Miyasho T, Takagi H, Suzuki H, Watanabe S, Inoue M, Kudo Y, Miyakawa H (2001) Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons: a modeling study. Brain Res 891:106-15 [PubMed]
Model Information (Click on a link to find other models with that property)
Model Type: Neuron or other electrically excitable cell;
Brain Region(s)/Organism:
Cell Type(s): Cerebellum Purkinje GABA cell;
Channel(s): I Na,p; I Na,t; I T low threshold; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium; I A, slow; I_KD;
Gap Junctions:
Receptor(s):
Gene(s):
Transmitter(s):
Simulation Environment: NEURON;
Model Concept(s): Action Potential Initiation; Activity Patterns; Dendritic Action Potentials; Bursting; Active Dendrites; Influence of Dendritic Geometry; Detailed Neuronal Models; Action Potentials; Calcium dynamics;
Implementer(s): Miyakawa, H [Miyakawa at ls.toyaku.ac.jp];
Search NeuronDB for information about:  Cerebellum Purkinje GABA cell; I Na,p; I Na,t; I T low threshold; I A; I K; I M; I K,Ca; I Sodium; I Calcium; I Potassium; I A, slow; I_KD;
/
prknj
readme
CaE.mod *
CalciumP.mod *
CaP.mod *
CaP2.mod *
CaT.mod *
K2.mod *
K22.mod *
K23.mod *
KA.mod *
KC.mod *
KC2.mod *
KC3.mod *
KD.mod *
Kdr.mod *
Kh.mod *
Khh.mod *
KM.mod *
Leak.mod *
NaF.mod *
NaP.mod *
mosinit.hoc
purkinje.hoc
purkinje.ses
                            
/*
Purkinje.hoc
A hoc file for a cerebellar Purkinje neuron.
Coded by MIYASHO Tsugumichi and MIYAKAWA Hiroyoshi.
This model runs on NEURON (version 3.2.3).
Description of this model can be found in 
"Low-threshold potassium channels and a low-threshold calcium channel regulate
Ca2+ spike firing in the dendrites of cerebellar Purkinje neurons : a modeling study"
(T. Miyasho et al., Brain Res 891, 2001, 106-115)

Morphology of the cell was taken from a paper by D.P.Shelton (Neuroscience 14, 1985, 111-131).
Most of the channels despriptions were taken from a paper by E.De.Shutter and 
J.M.Bower. (J. Neurophysiol., 71, 1994, 375-400)

*/
xopen("$(NEURONHOME)/lib/hoc/noload.hoc")

{load_proc("nrnmainmenu")} 
/*
{
	load_template("Inserter")
	load_template("Electrode")
	load_template("PointProcessManager")
	load_template("PointProcessLocator")
	load_template("ShowMechanism")
}
*/
NumSmoothDendrite=85
NumSpinyDendrite=1002

create soma, SmoothDendrite[NumSmoothDendrite], SpinyDendrite[NumSpinyDendrite]
access soma
    soma connect SmoothDendrite[0](0),1
    soma	      {nseg=1 L=22 diam=22 }
    SmoothDendrite[0] {nseg=1 L=18 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[1](0),1
    SmoothDendrite[1] {nseg=1 L=39 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[2](0),1
    SmoothDendrite[2] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[3](0),1
    SmoothDendrite[3] {nseg=1 L=7 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[2] connect SmoothDendrite[4](0),1
    SmoothDendrite[4] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[4] connect SmoothDendrite[5](0),1
    SmoothDendrite[5] {nseg=1 L=10 diam=2 }

    SmoothDendrite[1] connect SmoothDendrite[6](0),1
    SmoothDendrite[6] {nseg=1 L=10 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[7](0),1
    SmoothDendrite[7] {nseg=1 L=37 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[8](0),1
    SmoothDendrite[8] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[7] connect SmoothDendrite[9](0),1
    SmoothDendrite[9] {nseg=1 L=15 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[10](0),1
    SmoothDendrite[10] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[9] connect SmoothDendrite[11](0),1
    SmoothDendrite[11] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[11] connect SmoothDendrite[12](0),1
    SmoothDendrite[12] {nseg=1 L=7 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[12] connect SmoothDendrite[13](0),1
    SmoothDendrite[13] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[13] connect SmoothDendrite[14](0),1
    SmoothDendrite[14] {nseg=1 L=32 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[15](0),1
    SmoothDendrite[15] {nseg=1 L=11 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[17] connect SmoothDendrite[16](0),1
    SmoothDendrite[16] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[14] connect SmoothDendrite[17](0),1
    SmoothDendrite[17] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[15] connect SmoothDendrite[18](0),1
    SmoothDendrite[18] {nseg=1 L=12 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[18] connect SmoothDendrite[19](0),1
    SmoothDendrite[19] {nseg=1 L=8 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[19] connect SmoothDendrite[20](0),1
    SmoothDendrite[20] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[20] connect SmoothDendrite[21](0),1
    SmoothDendrite[21] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[21] connect SmoothDendrite[22](0),1
    SmoothDendrite[22] {nseg=1 L=27 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[22] connect SmoothDendrite[23](0),1
    SmoothDendrite[23] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[23] connect SmoothDendrite[24](0),1
    SmoothDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[6] connect SmoothDendrite[25](0),1
    SmoothDendrite[25] {nseg=1 L=10 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[26](0),1
    SmoothDendrite[26] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[26] connect SmoothDendrite[27](0),1
    SmoothDendrite[27] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[27] connect SmoothDendrite[28](0),1
    SmoothDendrite[28] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[28] connect SmoothDendrite[29](0),1
    SmoothDendrite[29] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[25] connect SmoothDendrite[30](0),1
    SmoothDendrite[30] {nseg=1 L=12 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[30] connect SmoothDendrite[31](0),1
    SmoothDendrite[31] {nseg=1 L=6 diam=5 }

    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[32](0),1
    SmoothDendrite[32] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[32] connect SmoothDendrite[33](0),1
    SmoothDendrite[33] {nseg=1 L=13 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[33] connect SmoothDendrite[34](0),1
    SmoothDendrite[34] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[31] connect SmoothDendrite[35](0),1
    SmoothDendrite[35] {nseg=1 L=22 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[36](0),1
    SmoothDendrite[36] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[35] connect SmoothDendrite[37](0),1
    SmoothDendrite[37] {nseg=1 L=4 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[37] connect SmoothDendrite[38](0),1
    SmoothDendrite[38] {nseg=1 L=20 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[39](0),1
    SmoothDendrite[39] {nseg=1 L=23 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[38] connect SmoothDendrite[40](0),1
    SmoothDendrite[40] {nseg=1 L=6 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[40] connect SmoothDendrite[41](0),1
    SmoothDendrite[41] {nseg=1 L=4 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[42](0),1
    SmoothDendrite[42] {nseg=1 L=1 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[42] connect SmoothDendrite[43](0),1
    SmoothDendrite[43] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[41] connect SmoothDendrite[44](0),1
    SmoothDendrite[44] {nseg=1 L=18 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[45](0),1
    SmoothDendrite[45] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[45] connect SmoothDendrite[46](0),1
    SmoothDendrite[46] {nseg=1 L=20 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[44] connect SmoothDendrite[47](0),1
    SmoothDendrite[47] {nseg=1 L=8 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[47] connect SmoothDendrite[48](0),1
    SmoothDendrite[48] {nseg=1 L=5 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[48] connect SmoothDendrite[49](0),1
    SmoothDendrite[49] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[49] connect SmoothDendrite[50](0),1
    SmoothDendrite[50] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[50] connect SmoothDendrite[51](0),1
    SmoothDendrite[51] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[0] connect SmoothDendrite[52](0),1
    SmoothDendrite[52] {nseg=1 L=22 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[53](0),1
    SmoothDendrite[53] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[53] connect SmoothDendrite[54](0),1
    SmoothDendrite[54] {nseg=1 L=18 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[52] connect SmoothDendrite[55](0),1
    SmoothDendrite[55] {nseg=1 L=22 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[56](0),1
    SmoothDendrite[56] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[55] connect SmoothDendrite[57](0),1
    SmoothDendrite[57] {nseg=1 L=2 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[57] connect SmoothDendrite[58](0),1
    SmoothDendrite[58] {nseg=1 L=3 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[58] connect SmoothDendrite[59](0),1
    SmoothDendrite[59] {nseg=1 L=3 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[60](0),1
    SmoothDendrite[60] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[59] connect SmoothDendrite[61](0),1
    SmoothDendrite[61] {nseg=1 L=14 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[62](0),1
    SmoothDendrite[62] {nseg=1 L=44 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[63](0),1
    SmoothDendrite[63] {nseg=1 L=12 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[63] connect SmoothDendrite[64](0),1
    SmoothDendrite[64] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[62] connect SmoothDendrite[65](0),1
    SmoothDendrite[65] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[65] connect SmoothDendrite[66](0),1
    SmoothDendrite[66] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[66] connect SmoothDendrite[67](0),1
    SmoothDendrite[67] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[67] connect SmoothDendrite[68](0),1
    SmoothDendrite[68] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SmoothDendrite[61] connect SmoothDendrite[69](0),1
    SmoothDendrite[69] {nseg=1 L=10 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[70](0),1
    SmoothDendrite[70] {nseg=1 L=4 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[70] connect SmoothDendrite[71](0),1
    SmoothDendrite[71] {nseg=1 L=4 diam=3 }
 
    SmoothDendrite[69] connect SmoothDendrite[72](0),1
    SmoothDendrite[72] {nseg=1 L=2 diam=6 }
 
    SmoothDendrite[72] connect SmoothDendrite[73](0),1
    SmoothDendrite[73] {nseg=1 L=24 diam=5 }
 
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[74](0),1
    SmoothDendrite[74] {nseg=1 L=52 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[74] connect SmoothDendrite[75](0),1
    SmoothDendrite[75] {nseg=1 L=16 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[73] connect SmoothDendrite[76](0),1
    SmoothDendrite[76] {nseg=1 L=14 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[76] connect SmoothDendrite[77](0),1
    SmoothDendrite[77] {nseg=1 L=2 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[77] connect SmoothDendrite[78](0),1
    SmoothDendrite[78] {nseg=1 L=14 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[78] connect SmoothDendrite[79](0),1
    SmoothDendrite[79] {nseg=1 L=24 diam=4 }
 
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[80](0),1
    SmoothDendrite[80] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[79] connect SmoothDendrite[81](0),1
    SmoothDendrite[81] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[81] connect SmoothDendrite[82](0),1
    SmoothDendrite[82] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SmoothDendrite[82] connect SmoothDendrite[83](0),1
    SmoothDendrite[83] {nseg=1 L=6 diam=2 }

    SmoothDendrite[83] connect SmoothDendrite[84](0),1
    SmoothDendrite[84] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    soma               {cm=0.8    
         insert Leak gl_Leak = 0.00006 el_Leak = -80
	 insert NaF  gnabar_NaF = 10
         insert NaP
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.0005
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0
         insert Khh
         insert KM
         insert KA 
         insert KD  gkbar_KD  = 0
         insert Kh   gkbar_Kh = 0.0005
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}
    for i=0,84 SmoothDendrite[i]  {cm=0.8  
         insert Leak gl_Leak = 0.00021 el_Leak = -80
         insert CaP2 cai = 4e-5 cao = 2.4 gcabar_CaP2 = 0.004
         insert CaT cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaT = 0.0015
         insert CaE cai = 4e-5 cao = 2.4  gcabar_CaE = 0.008
         insert Khh gkbar_Khh = 0.0006
         insert KM  gkbar_KM  = 0.00001
         insert KA  gkbar_KA  = 0.08
         insert KD  gkbar_KD  = 0.09
         insert KC3 gkbar_KC3  = 0.06
         insert K23
         insert cad taur_cad = 2 cainf_cad = 4e-5
		    kt_cad = 4e-5 kd_cad = 4e-5 
}


/**** Spiny 1 ****/
    SmoothDendrite[53] connect SpinyDendrite[0](0),1
    SpinyDendrite[0] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 

/**** Spiny 2 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[1](0),1
    SpinyDendrite[1] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[2](0),1
    SpinyDendrite[2] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[3](0),1
    SpinyDendrite[3] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[2] connect SpinyDendrite[4](0),1
    SpinyDendrite[4] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[1] connect SpinyDendrite[5](0),1
    SpinyDendrite[5] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[6](0),1
    SpinyDendrite[6] {nseg=1 L=5 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[5] connect SpinyDendrite[7](0),1
    SpinyDendrite[7] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
 
/**** Spiny 3 ****/
    SmoothDendrite[54] connect SpinyDendrite[8](0),1
    SpinyDendrite[8] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[9](0),1
    SpinyDendrite[9] {nseg=1 L=9 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[8] connect SpinyDendrite[10](0),1
    SpinyDendrite[10] {nseg=1 L=5 diam=2.0 }
 
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[11](0),1
    SpinyDendrite[11] {nseg=1 L=10 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[10] connect SpinyDendrite[12](0),1
    SpinyDendrite[12] {nseg=1 L=2 diam=2.0 }
 
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[13](0),1
    SpinyDendrite[13] {nseg=1 L=13 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[14](0),1
    SpinyDendrite[14] {nseg=1 L=7 diam=1.0 }
 
    SpinyDendrite[13] connect SpinyDendrite[15](0),1
    SpinyDendrite[15] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[12] connect SpinyDendrite[16](0),1
    SpinyDendrite[16] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[17](0),1
    SpinyDendrite[17] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[16] connect SpinyDendrite[18](0),1
    SpinyDendrite[18] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[19](0),1
    SpinyDendrite[19] {nseg=1 L=3 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[18] connect SpinyDendrite[20](0),1
    SpinyDendrite[20] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[21](0),1
    SpinyDendrite[21] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[20] connect SpinyDendrite[22](0),1
    SpinyDendrite[22] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[23](0),1
    SpinyDendrite[23] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[22] connect SpinyDendrite[24](0),1
    SpinyDendrite[24] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[25](0),1
    SpinyDendrite[25] {nseg=1 L=2 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[24] connect SpinyDendrite[26](0),1
    SpinyDendrite[26] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[27](0),1
    SpinyDendrite[27] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[26] connect SpinyDendrite[28](0),1
    SpinyDendrite[28] {nseg=1 L=4 diam=1 }


/**** Spiny 4 ****/
    SmoothDendrite[56] connect SpinyDendrite[29](0),1
    SpinyDendrite[29] {nseg=1 L=11 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[30](0),1
    SpinyDendrite[30] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[31](0),1
    SpinyDendrite[31] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[30] connect SpinyDendrite[32](0),1
    SpinyDendrite[32] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[29] connect SpinyDendrite[33](0),1
    SpinyDendrite[33] {nseg=1 L=2 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[34](0),1
    SpinyDendrite[34] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[33] connect SpinyDendrite[35](0),1
    SpinyDendrite[35] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[35] connect SpinyDendrite[36](0),1
    SpinyDendrite[36] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[37](0),1
    SpinyDendrite[37] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[38](0),1
    SpinyDendrite[38] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[37] connect SpinyDendrite[39](0),1
    SpinyDendrite[39] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[36] connect SpinyDendrite[40](0),1
    SpinyDendrite[40] {nseg=1 L=7 diam=1 }
 
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/**** Spiny 5 ****/
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/**** Spiny 6 ****/
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/**** Spiny 7 ****/
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/**** Spiny 8 ****/
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/**** Spiny 9 ****/
    SmoothDendrite[71] connect SpinyDendrite[74](0),1
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    SpinyDendrite[85] {nseg=1 L=23 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[87] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
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/**** Spiny 10 ****/
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/**** Spiny 11 ****/
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    SpinyDendrite[107] {nseg=1 L=3 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[104] connect SpinyDendrite[108](0),1
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    SpinyDendrite[108] connect SpinyDendrite[110](0),1
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    SpinyDendrite[110] connect SpinyDendrite[111](0),1
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/**** Spiny 12 ****/
    SmoothDendrite[77] connect SpinyDendrite[113](0),1
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    SpinyDendrite[115] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
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    SpinyDendrite[117] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[118] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[119] {nseg=1 L=12 diam=1 }

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    SpinyDendrite[124] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[126] connect SpinyDendrite[127](0),1
    SpinyDendrite[127] {nseg=1 L=9 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[126] connect SpinyDendrite[128](0),1
    SpinyDendrite[128] {nseg=1 L=9 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[125] connect SpinyDendrite[129](0),1
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    SpinyDendrite[129] connect SpinyDendrite[130](0),1
    SpinyDendrite[130] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[129] connect SpinyDendrite[131](0),1
    SpinyDendrite[131] {nseg=1 L=9 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[131] connect SpinyDendrite[132](0),1
    SpinyDendrite[132] {nseg=1 L=15 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[131] connect SpinyDendrite[133](0),1
    SpinyDendrite[133] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 13 ****/
    SmoothDendrite[78] connect SpinyDendrite[134](0),1
    SpinyDendrite[134] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[134] connect SpinyDendrite[135](0),1
    SpinyDendrite[135] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
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    SpinyDendrite[136] {nseg=1 L=14 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[137] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
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    SpinyDendrite[138] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[138] connect SpinyDendrite[139](0),1
    SpinyDendrite[139] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[140](0),1
    SpinyDendrite[140] {nseg=1 L=24 diam=1 }

    SpinyDendrite[139] connect SpinyDendrite[141](0),1
    SpinyDendrite[141] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[138] connect SpinyDendrite[142](0),1
    SpinyDendrite[142] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[143](0),1
    SpinyDendrite[143] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[142] connect SpinyDendrite[144](0),1
    SpinyDendrite[144] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[144] connect SpinyDendrite[145](0),1
    SpinyDendrite[145] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[144] connect SpinyDendrite[146](0),1
    SpinyDendrite[146] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[147](0),1
    SpinyDendrite[147] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[146] connect SpinyDendrite[148](0),1
    SpinyDendrite[148] {nseg=1 L=6 diam=1 }
/**** Spiny 14 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[149](0),1
    SpinyDendrite[149] {nseg=1 L=4 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[150](0),1
    SpinyDendrite[150] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[150] connect SpinyDendrite[151](0),1
    SpinyDendrite[151] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[150] connect SpinyDendrite[152](0),1
    SpinyDendrite[152] {nseg=1 L=8 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[149] connect SpinyDendrite[153](0),1
    SpinyDendrite[153] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[154](0),1
    SpinyDendrite[154] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[153] connect SpinyDendrite[155](0),1
    SpinyDendrite[155] {nseg=1 L=6 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[155] connect SpinyDendrite[156](0),1
    SpinyDendrite[156] {nseg=1 L=9 diam=1}
 
    SpinyDendrite[155] connect SpinyDendrite[157](0),1
    SpinyDendrite[157] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[157] connect SpinyDendrite[158](0),1
    SpinyDendrite[158] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[157] connect SpinyDendrite[159](0),1
    SpinyDendrite[159] {nseg=1 L=24 diam=1 }


/**** Spiny 15 ****/
    SmoothDendrite[80] connect SpinyDendrite[160](0),1
    SpinyDendrite[160] {nseg=1 L=14 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[160] connect SpinyDendrite[161](0),1
    SpinyDendrite[161] {nseg=1 L=12 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[160] connect SpinyDendrite[162](0),1
    SpinyDendrite[162] {nseg=1 L=3 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[163](0),1
    SpinyDendrite[163] {nseg=1 L=13 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[162] connect SpinyDendrite[164](0),1
    SpinyDendrite[164] {nseg=1 L=10 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[164] connect SpinyDendrite[165](0),1
    SpinyDendrite[165] {nseg=1 L=12 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[166](0),1
    SpinyDendrite[166] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[165] connect SpinyDendrite[167](0),1
    SpinyDendrite[167] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[164] connect SpinyDendrite[168](0),1
    SpinyDendrite[168] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[169](0),1
    SpinyDendrite[169] {nseg=1 L=26 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[168] connect SpinyDendrite[170](0),1
    SpinyDendrite[170] {nseg=1 L=5 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[171](0),1
    SpinyDendrite[171] {nseg=1 L=4 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[170] connect SpinyDendrite[172](0),1
    SpinyDendrite[172] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 16 ****/
    SmoothDendrite[81] connect SpinyDendrite[173](0),1
    SpinyDendrite[173] {nseg=1 L=2 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[173] connect SpinyDendrite[174](0),1
    SpinyDendrite[174] {nseg=1 L=18 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[173] connect SpinyDendrite[175](0),1
    SpinyDendrite[175] {nseg=1 L=6 diam=1 }


/**** Spiny 17 ****/
    SmoothDendrite[84] connect SpinyDendrite[176](0),1
    SpinyDendrite[176] {nseg=1 L=8 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[177](0),1
    SpinyDendrite[177] {nseg=1 L=40 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[176] connect SpinyDendrite[178](0),1
    SpinyDendrite[178] {nseg=1 L=9 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[179](0),1
    SpinyDendrite[179] {nseg=1 L=11 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[180](0),1
    SpinyDendrite[180] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[181](0),1
    SpinyDendrite[181] {nseg=1 L=17 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[180] connect SpinyDendrite[182](0),1
    SpinyDendrite[182] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[179] connect SpinyDendrite[183](0),1
    SpinyDendrite[183] {nseg=1 L=10 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[178] connect SpinyDendrite[184](0),1
    SpinyDendrite[184] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }
 
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[185](0),1
    SpinyDendrite[185] {nseg=1 L=22 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[184] connect SpinyDendrite[186](0),1
    SpinyDendrite[186] {nseg=1 L=10 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[186] connect SpinyDendrite[187](0),1
    SpinyDendrite[187] {nseg=1 L=6 diam=1 }
 
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/**** Spiny 18 ****/
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/**** Spiny 22 ****/
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/**** Spiny 23 ****/
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/**** Spiny 24 ****/
    SmoothDendrite[74] connect SpinyDendrite[265](0),1
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    SpinyDendrite[265] connect SpinyDendrite[267](0),1
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/**** Spiny 25 ****/
    SmoothDendrite[64] connect SpinyDendrite[268](0),1
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    SpinyDendrite[271] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[270] connect SpinyDendrite[272](0),1
    SpinyDendrite[272] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[272] connect SpinyDendrite[273](0),1
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    SpinyDendrite[272] connect SpinyDendrite[274](0),1
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    SpinyDendrite[274] connect SpinyDendrite[275](0),1
    SpinyDendrite[275] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[274] connect SpinyDendrite[276](0),1
    SpinyDendrite[276] {nseg=1 L=7 diam=2 }

    SpinyDendrite[276] connect SpinyDendrite[277](0),1
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    SpinyDendrite[277] connect SpinyDendrite[278](0),1
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    SpinyDendrite[277] connect SpinyDendrite[279](0),1
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    SpinyDendrite[276] connect SpinyDendrite[280](0),1
    SpinyDendrite[280] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[280] connect SpinyDendrite[281](0),1
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    SpinyDendrite[282] connect SpinyDendrite[283](0),1
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    SpinyDendrite[282] connect SpinyDendrite[284](0),1
    SpinyDendrite[284] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 26 ****/
    SmoothDendrite[64] connect SpinyDendrite[285](0),1
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    SpinyDendrite[285] connect SpinyDendrite[286](0),1
    SpinyDendrite[286] {nseg=1 L=22 diam=1 }

    SpinyDendrite[285] connect SpinyDendrite[287](0),1
    SpinyDendrite[287] {nseg=1 L=6 diam=2 }

    SpinyDendrite[287] connect SpinyDendrite[288](0),1
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    SpinyDendrite[288] connect SpinyDendrite[289](0),1
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    SpinyDendrite[289] connect SpinyDendrite[290](0),1
    SpinyDendrite[290] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[289] connect SpinyDendrite[291](0),1
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    SpinyDendrite[288] connect SpinyDendrite[292](0),1
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    SpinyDendrite[287] connect SpinyDendrite[293](0),1
    SpinyDendrite[293] {nseg=1 L=15 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[293] connect SpinyDendrite[294](0),1
    SpinyDendrite[294] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[293] connect SpinyDendrite[295](0),1
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    SpinyDendrite[295] connect SpinyDendrite[296](0),1
    SpinyDendrite[296] {nseg=1 L=15 diam=1 }

    SpinyDendrite[295] connect SpinyDendrite[297](0),1
    SpinyDendrite[297] {nseg=1 L=8 diam=1 }


/**** Spiny 27 ****/
    SmoothDendrite[63] connect SpinyDendrite[298](0),1
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/**** Spiny 28 ****/
    SmoothDendrite[66] connect SpinyDendrite[299](0),1
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    SpinyDendrite[299] connect SpinyDendrite[300](0),1
    SpinyDendrite[300] {nseg=1 L=10 diam=1 }

    SpinyDendrite[299] connect SpinyDendrite[301](0),1
    SpinyDendrite[301] {nseg=1 L=4 diam=1 }


/**** Spiny 29 ****/
    SmoothDendrite[67] connect SpinyDendrite[302](0),1
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    SpinyDendrite[302] connect SpinyDendrite[303](0),1
    SpinyDendrite[303] {nseg=1 L=12 diam=1 }

    SpinyDendrite[302] connect SpinyDendrite[304](0),1
    SpinyDendrite[304] {nseg=1 L=5 diam=1 }


/**** Spiny 30 ****/
    SmoothDendrite[68] connect SpinyDendrite[305](0),1
    SpinyDendrite[305] {nseg=1 L=6 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[305] connect SpinyDendrite[306](0),1
    SpinyDendrite[306] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[305] connect SpinyDendrite[307](0),1
    SpinyDendrite[307] {nseg=1 L=12 diam=2 }

    SpinyDendrite[307] connect SpinyDendrite[308](0),1
    SpinyDendrite[308] {nseg=1 L=8 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[308] connect SpinyDendrite[309](0),1
    SpinyDendrite[309] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[308] connect SpinyDendrite[310](0),1
    SpinyDendrite[310] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[309] connect SpinyDendrite[311](0),1
    SpinyDendrite[311] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[311] connect SpinyDendrite[312](0),1
    SpinyDendrite[312] {nseg=1 L=7 diam=1 }

    SpinyDendrite[311] connect SpinyDendrite[313](0),1
    SpinyDendrite[313] {nseg=1 L=9 diam=1 }


/**** Spiny 31 ****/
    SmoothDendrite[68] connect SpinyDendrite[314](0),1
    SpinyDendrite[314] {nseg=1 L=5 diam=2 }
 
    SpinyDendrite[314] connect SpinyDendrite[315](0),1
    SpinyDendrite[315] {nseg=1 L=4 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[315] connect SpinyDendrite[316](0),1
    SpinyDendrite[316] {nseg=1 L=1 diam=1.4 }

    SpinyDendrite[316] connect SpinyDendrite[317](0),1
    SpinyDendrite[317] {nseg=1 L=14 diam=1 }

    SpinyDendrite[316] connect SpinyDendrite[318](0),1
    SpinyDendrite[318] {nseg=1 L=11 diam=1 }

    SpinyDendrite[315] connect SpinyDendrite[319](0),1
    SpinyDendrite[319] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[314] connect SpinyDendrite[320](0),1
    SpinyDendrite[320] {nseg=1 L=2 diam=2 }

    SpinyDendrite[320] connect SpinyDendrite[321](0),1
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    SpinyDendrite[321] connect SpinyDendrite[322](0),1
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    SpinyDendrite[321] connect SpinyDendrite[323](0),1
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    SpinyDendrite[320] connect SpinyDendrite[324](0),1
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    SpinyDendrite[324] connect SpinyDendrite[325](0),1
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    SpinyDendrite[324] connect SpinyDendrite[326](0),1
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/**** Spiny 32 ****/
    SmoothDendrite[65] connect SpinyDendrite[327](0),1
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    SpinyDendrite[327] connect SpinyDendrite[328](0),1
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    SpinyDendrite[328] connect SpinyDendrite[329](0),1
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    SpinyDendrite[329] connect SpinyDendrite[330](0),1
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    SpinyDendrite[330] connect SpinyDendrite[331](0),1
    SpinyDendrite[331] {nseg=1 L=3 diam=1.4 }

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/**** Spiny 34 ****/
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/**** Spiny 38 ****/
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/**** Spiny 39 ****/
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/**** Spiny 40 ****/
    SmoothDendrite[30] connect SpinyDendrite[417](0),1
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    SpinyDendrite[422] connect SpinyDendrite[423](0),1
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    SpinyDendrite[427] connect SpinyDendrite[428](0),1
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/**** Spiny 41 ****/
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/**** Spiny 42 ****/
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/**** Spiny 43 ****/
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    SpinyDendrite[451] connect SpinyDendrite[452](0),1
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    SpinyDendrite[451] connect SpinyDendrite[453](0),1
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    SpinyDendrite[449] connect SpinyDendrite[454](0),1
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    SpinyDendrite[450] connect SpinyDendrite[455](0),1
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/**** Spiny 44 ****/
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/**** Spiny 45 ****/
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/**** Spiny 48 ****/
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/**** Spiny 49 ****/
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/**** Spiny 50 ****/
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    SpinyDendrite[543] connect SpinyDendrite[544](0),1
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/**** Spiny 51 ****/
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    SpinyDendrite[552] connect SpinyDendrite[553](0),1
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/**** Spiny 52 ****/
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    SpinyDendrite[563] {nseg=1 L=4 diam=2 }

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    SpinyDendrite[572] {nseg=1 L=5 diam=1 }

    SpinyDendrite[571] connect SpinyDendrite[573](0),1
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/**** Spiny 53 ****/
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/**** Spiny 54 ****/
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    SpinyDendrite[577] connect SpinyDendrite[579](0),1
    SpinyDendrite[579] {nseg=1 L=3 diam=1 }


/**** Spiny 55 ****/
    SmoothDendrite[46] connect SpinyDendrite[580](0),1
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    SpinyDendrite[582] connect SpinyDendrite[583](0),1
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    SpinyDendrite[584] connect SpinyDendrite[585](0),1
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    SpinyDendrite[586] connect SpinyDendrite[590](0),1
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/**** Spiny 56 ****/
    SmoothDendrite[46] connect SpinyDendrite[597](0),1
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    SpinyDendrite[603] {nseg=1 L=22 diam=1 }

    SpinyDendrite[598] connect SpinyDendrite[604](0),1
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    SpinyDendrite[597] connect SpinyDendrite[607](0),1
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    SpinyDendrite[607] connect SpinyDendrite[609](0),1
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    SpinyDendrite[609] connect SpinyDendrite[610](0),1
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    SpinyDendrite[610] connect SpinyDendrite[611](0),1
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    SpinyDendrite[611] connect SpinyDendrite[612](0),1
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    SpinyDendrite[611] connect SpinyDendrite[613](0),1
    SpinyDendrite[613] {nseg=1 L=4 diam=1 }

    SpinyDendrite[610] connect SpinyDendrite[614](0),1
    SpinyDendrite[614] {nseg=1 L=6 diam=1 }

    SpinyDendrite[609] connect SpinyDendrite[615](0),1
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    SpinyDendrite[615] connect SpinyDendrite[616](0),1
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    SpinyDendrite[616] connect SpinyDendrite[618](0),1
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    SpinyDendrite[615] connect SpinyDendrite[619](0),1
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    SpinyDendrite[619] connect SpinyDendrite[620](0),1
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    SpinyDendrite[619] connect SpinyDendrite[621](0),1
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/**** Spiny 57 ****/
    SmoothDendrite[40] connect SpinyDendrite[622](0),1
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    SpinyDendrite[622] connect SpinyDendrite[623](0),1
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    SpinyDendrite[623] connect SpinyDendrite[624](0),1
    SpinyDendrite[624] {nseg=1 L=27 diam=1 }

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    SpinyDendrite[625] {nseg=1 L=11 diam=1 }

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    SpinyDendrite[627] connect SpinyDendrite[628](0),1
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/**** Spiny 67 ****/
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    SpinyDendrite[754] {nseg=1 L=16 diam=1 }

    SpinyDendrite[753] connect SpinyDendrite[755](0),1
    SpinyDendrite[755] {nseg=1 L=8 diam=1 }

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/**** Spiny 68 ****/
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 /**** Spiny 76 ****/
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/**** Spiny 77 ****/
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/**** Spiny 78 ****/
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    SpinyDendrite[867] connect SpinyDendrite[873](0),1
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    SpinyDendrite[876] {nseg=1 L=6 diam=1 }

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/**** Spiny 79 ****/
    SmoothDendrite[10] connect SpinyDendrite[880](0),1
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/**** Spiny 80 ****/
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    SpinyDendrite[897] connect SpinyDendrite[899](0),1
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    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[900](0),1
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    SpinyDendrite[899] connect SpinyDendrite[901](0),1
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/**** Spiny 81 ****/
    SmoothDendrite[8] connect SpinyDendrite[902](0),1
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    SpinyDendrite[902] connect SpinyDendrite[903](0),1
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    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[904](0),1
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    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[906](0),1
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    SpinyDendrite[905] connect SpinyDendrite[907](0),1
    SpinyDendrite[907] {nseg=1 L=2 diam=1 }

    SpinyDendrite[903] connect SpinyDendrite[908](0),1
    SpinyDendrite[908] {nseg=1 L=8 diam=1 }

    SpinyDendrite[904] connect SpinyDendrite[909](0),1
    SpinyDendrite[909] {nseg=1 L=3 diam=1 }

    SpinyDendrite[902] connect SpinyDendrite[910](0),1
    SpinyDendrite[910] {nseg=1 L=5 diam=2 }

    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[911](0),1
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    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[912](0),1
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    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[913](0),1
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    SpinyDendrite[912] connect SpinyDendrite[914](0),1
    SpinyDendrite[914] {nseg=1 L=5 diam=1 }
 
    SpinyDendrite[911] connect SpinyDendrite[915](0),1
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    SpinyDendrite[910] connect SpinyDendrite[916](0),1
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    SpinyDendrite[916] connect SpinyDendrite[917](0),1
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    SpinyDendrite[918] connect SpinyDendrite[920](0),1
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/**** Spiny 82 ****/
    SmoothDendrite[4] connect SpinyDendrite[923](0),1
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global_ra = 250
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